More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7061 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  100 
 
 		 297 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  48.66 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  47.14 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  38.49 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.46 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  37.42 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.96 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  36.13 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.75 
 
 		 341 aa  198  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.58 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  37.67 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  38.14 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.31 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  42.4 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  37.5 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  36.01 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  34.94 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  37.46 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  35.95 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4120  ABC transporter related protein  34.77 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  33.67 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  35.23 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0249  ABC transporter related  35.65 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  35.86 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  38.93 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.44 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.86 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  36.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  36.1 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  34.71 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  35.79 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.55 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.55 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.55 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  35.76 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  37.17 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.89 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.55 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  37.29 
 
 		 949 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  36.58 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  35.55 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  34.65 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  35.81 
 
 		 897 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  41.55 
 
 		 876 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  38.91 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  35.45 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.24 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  35.81 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  32.55 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  41.28 
 
 		 866 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  37.83 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  42.4 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  36.24 
 
 		 948 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.44 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.78 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  39.15 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  43.48 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  42.33 
 
 		 347 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  31.39 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  36.75 
 
 		 968 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  35.79 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.28 
 
 		 944 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.88 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.66 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 323 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  35.71 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  40 
 
 		 230 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  35.03 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>