More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1233 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1233  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.954644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  48.74 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0135458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  47.48 
 
 		 237 aa  228  4e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  38.53 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.5 
 
 		 308 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 		 317 aa  150  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.56 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.73 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 309 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.04 
 
 		 317 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.59 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.24 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.19 
 
 		 319 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  35.91 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 360 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  36.07 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  37.05 
 
 		 301 aa  141  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  37.84 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  35.53 
 
 		 303 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  34.68 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  37.39 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.89 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  34.53 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  37.56 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 308 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  34.68 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.01 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.86 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  35.27 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.33 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  35.74 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.22 
 
 		 299 aa  138  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 		 312 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.81 
 
 		 301 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0385  ABC transporter related  35.38 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  35.02 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  33.03 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  36.44 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  36.57 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.24 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  31.82 
 
 		 341 aa  135  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  37.16 
 
 		 305 aa  135  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  35.34 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  36.56 
 
 		 295 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  36.11 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  36.24 
 
 		 329 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  38.18 
 
 		 576 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.42 
 
 		 328 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  36.05 
 
 		 308 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.91 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  34.42 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  37.24 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  32.58 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  38.33 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.76 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  35.35 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  34.23 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0208  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.17 
 
 		 320 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.5 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.7 
 
 		 312 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  35.91 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  35.98 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  31.67 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  37.67 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.84 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 318 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  34.72 
 
 		 283 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.06 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  33.64 
 
 		 316 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 309 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  33.33 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  36.32 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>