More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0352 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0352  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  521  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2701  ABC transporter related  66.53 
 
 
241 aa  323  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128649  normal  0.0320572 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  54.29 
 
 
259 aa  255  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  54.31 
 
 
252 aa  248  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 
238 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  48.95 
 
 
242 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  48.05 
 
 
237 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  47.6 
 
 
239 aa  227  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1457  ABC transporter related  48.67 
 
 
241 aa  224  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
247 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0830  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
226 aa  192  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  42.6 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.2 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  44.7 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
335 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
241 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
241 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
241 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 
241 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 
241 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
241 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  37.74 
 
 
250 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
241 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  37.74 
 
 
250 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  43.13 
 
 
250 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
310 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  42.31 
 
 
301 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.91 
 
 
259 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35 
 
 
246 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
253 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  37.56 
 
 
241 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  37.16 
 
 
247 aa  155  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
241 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 
241 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
301 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  39.81 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  38.46 
 
 
284 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.43 
 
 
332 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
241 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  37.87 
 
 
241 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  42.45 
 
 
279 aa  151  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  43.35 
 
 
326 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.45 
 
 
259 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.45 
 
 
316 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  40.47 
 
 
316 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  39.34 
 
 
303 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 
301 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  36.56 
 
 
319 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
310 aa  148  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  38.76 
 
 
308 aa  148  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.84 
 
 
316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  38.21 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  39.05 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0135458 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  42.59 
 
 
339 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  34.87 
 
 
246 aa  146  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  38.18 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  33.96 
 
 
272 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  38.28 
 
 
303 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.32 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  37.09 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.8 
 
 
295 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  39.62 
 
 
337 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
303 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
252 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  35 
 
 
338 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 
312 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
309 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
305 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  33.2 
 
 
298 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
266 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
287 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.8 
 
 
309 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.13 
 
 
304 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
305 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
322 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
342 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  36.45 
 
 
338 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
308 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  38.03 
 
 
242 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  35.85 
 
 
312 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  36.62 
 
 
512 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.98 
 
 
338 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  39.02 
 
 
331 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 
309 aa  142  6e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  36.4 
 
 
321 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  33.49 
 
 
249 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  37.98 
 
 
237 aa  142  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  36.4 
 
 
321 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  35.48 
 
 
250 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.37 
 
 
741 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.81 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  38.65 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  34.14 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  35.94 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  35.63 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.19 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>