More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2485 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  100 
 
 
324 aa  635    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  64.29 
 
 
312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  63.12 
 
 
333 aa  344  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  57.72 
 
 
342 aa  337  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  54.14 
 
 
359 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.09 
 
 
301 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.28 
 
 
310 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
305 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  36.6 
 
 
305 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 
305 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.37 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  40.48 
 
 
282 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
304 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.64 
 
 
304 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.6 
 
 
330 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  44.44 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.8 
 
 
290 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  32.3 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.15 
 
 
305 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.64 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  37.85 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.5 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.07 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.81 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  39.46 
 
 
756 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  39.4 
 
 
326 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  38.67 
 
 
304 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.21 
 
 
308 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  40.07 
 
 
318 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  39.46 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  38.39 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 
320 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  40.94 
 
 
303 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  41.16 
 
 
301 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  40.13 
 
 
308 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  39.91 
 
 
254 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  36.45 
 
 
301 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
280 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  36.45 
 
 
297 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  43.29 
 
 
290 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.49 
 
 
330 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.26 
 
 
741 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.28 
 
 
319 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 
328 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  36.09 
 
 
312 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  38.82 
 
 
328 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  35.46 
 
 
311 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  37.94 
 
 
345 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  35.56 
 
 
339 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  39.22 
 
 
256 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 
293 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  37.77 
 
 
312 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  35.06 
 
 
333 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.83 
 
 
325 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  36.74 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 
310 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  35.33 
 
 
339 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  33.77 
 
 
315 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 
310 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  38.12 
 
 
256 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.32 
 
 
302 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.95 
 
 
321 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  34.11 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
280 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  38.54 
 
 
314 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  37.58 
 
 
322 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  34.24 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  36.62 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  38.87 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  34.24 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  36.79 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  37.46 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  38.87 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  38.87 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  38.87 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  35.93 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  37.38 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  34.88 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  35.99 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  38.49 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  38.87 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  38.87 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.26 
 
 
308 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  31.09 
 
 
312 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  38.96 
 
 
333 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>