More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.21 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  41.37 
 
 
279 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.82 
 
 
309 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  40.29 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.2 
 
 
279 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  38.13 
 
 
279 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.07 
 
 
282 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
328 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 
326 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  40.93 
 
 
307 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 
339 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
328 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.33 
 
 
328 aa  202  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
329 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
327 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
330 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.96 
 
 
325 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.55 
 
 
324 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  42.86 
 
 
321 aa  192  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.45 
 
 
322 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  44.08 
 
 
315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  44.08 
 
 
315 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.29 
 
 
325 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.85 
 
 
330 aa  188  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.88 
 
 
324 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
317 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
311 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 
324 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  37.17 
 
 
310 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.64 
 
 
334 aa  185  6e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.39 
 
 
343 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
324 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  37.32 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.03 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 
333 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
241 aa  183  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 
255 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  34.69 
 
 
300 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  37.38 
 
 
332 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  39.55 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
348 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  42.92 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.71 
 
 
326 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.8 
 
 
327 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 
308 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  36.18 
 
 
310 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.86 
 
 
326 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.64 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  36.98 
 
 
308 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
325 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  41.38 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  36.58 
 
 
302 aa  178  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.64 
 
 
322 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  41.52 
 
 
330 aa  178  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  42.47 
 
 
307 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  41.71 
 
 
309 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  40.45 
 
 
314 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  33.77 
 
 
305 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.44 
 
 
317 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.52 
 
 
329 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.44 
 
 
321 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 
319 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  36.36 
 
 
270 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  40.89 
 
 
275 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 
315 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  36.24 
 
 
320 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  40.65 
 
 
311 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.23 
 
 
325 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
327 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  40.79 
 
 
320 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  36.8 
 
 
247 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  34.92 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  38.79 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  40 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.12 
 
 
315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.33 
 
 
334 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  42.18 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  39.29 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.58 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  35.43 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  39.08 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  40.54 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  35.79 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
369 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34 
 
 
323 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  35.61 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.86 
 
 
512 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  37.3 
 
 
315 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>