More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13320  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.48 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.24 
 
 
331 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  48.86 
 
 
311 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  50.91 
 
 
309 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  50.25 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  46.67 
 
 
322 aa  198  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  55.66 
 
 
329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
308 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
302 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  46.19 
 
 
315 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  52.06 
 
 
299 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  55.72 
 
 
334 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  45.57 
 
 
388 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  48.54 
 
 
374 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  49.14 
 
 
308 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  42.55 
 
 
308 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  52.02 
 
 
319 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.86 
 
 
321 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  43.86 
 
 
312 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
300 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
338 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
310 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  43.1 
 
 
310 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  41.63 
 
 
314 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  43.1 
 
 
310 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  42.67 
 
 
310 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  42.24 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  43.38 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.37 
 
 
308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  42.47 
 
 
298 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
314 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
237 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43 
 
 
314 aa  158  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.2 
 
 
342 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  39.01 
 
 
285 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  44.28 
 
 
284 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.19 
 
 
305 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  40.51 
 
 
305 aa  154  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
303 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.97 
 
 
304 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  40.85 
 
 
324 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  34.72 
 
 
301 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  41.41 
 
 
756 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
302 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  40.17 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.48 
 
 
741 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
306 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.64 
 
 
308 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
297 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  37.62 
 
 
305 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  40 
 
 
302 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
311 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2042  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.94 
 
 
328 aa  148  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025568  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
305 aa  148  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  33.94 
 
 
256 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
331 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 
353 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  41.71 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  40.19 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  31.96 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  32.16 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  41.38 
 
 
276 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2293  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 
327 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  40.64 
 
 
324 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 
295 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.55 
 
 
322 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  32.39 
 
 
310 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.73 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
302 aa  144  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.57 
 
 
338 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  41.86 
 
 
329 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  40.89 
 
 
320 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  31.47 
 
 
300 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
301 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
330 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.9 
 
 
353 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 
320 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
345 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  41.46 
 
 
342 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.43 
 
 
347 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.45 
 
 
319 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.94 
 
 
323 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.61 
 
 
343 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.45 
 
 
312 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
301 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  38.81 
 
 
307 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.74 
 
 
323 aa  141  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.18 
 
 
335 aa  141  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  33.05 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  39.34 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>