More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6847 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  53.06 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  44.86 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  48.32 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  47.09 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  44 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.78 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 312 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  43.26 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 311 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 312 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  43.38 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  42.36 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.58 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  42.98 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  42.01 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  42.73 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  42.11 
 
 		 319 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  42.22 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  42.11 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3971  ABC transporter related  40.09 
 
 		 306 aa  174  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 		 315 aa  174  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  40.44 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.18 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  41.96 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  39.62 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  40.18 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  39.27 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  42.67 
 
 		 320 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.39 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  41.48 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  38.63 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 312 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 311 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  39.91 
 
 		 312 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.39 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  41.9 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  41.9 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  38.87 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  41.9 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  41.9 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  39.82 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.81 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  38.43 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  40 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  42.06 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  40.18 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  41.45 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  40.18 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  39.39 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 326 aa  165  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  40 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  40.18 
 
 		 312 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 		 310 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  41.7 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  38.1 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  39.82 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  39.57 
 
 		 311 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  38.84 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  39.01 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  39.57 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  39.07 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.61 
 
 		 335 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  39.53 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  39.82 
 
 		 310 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40.76 
 
 		 325 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  41.2 
 
 		 304 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2371  ABC transporter related  40.85 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0363679  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  40.35 
 
 		 335 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  40.89 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  40.18 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  38.94 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6125  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.08 
 
 		 403 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.897652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>