More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0819 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  100 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  47.55 
 
 		 289 aa  262  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  43.36 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  42.81 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  39.65 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  43.71 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  43.01 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  41.61 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.13 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  37.54 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  40.07 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  36.81 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  41.11 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  39.22 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.01 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  40.69 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  42.48 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  38.46 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  40.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  42.48 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  37.54 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  39.46 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  40.42 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  36.14 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  38.03 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.03 
 
 		 331 aa  178  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  38.36 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  40.67 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  34.64 
 
 		 328 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.61 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  43.22 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.55 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.09 
 
 		 344 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  39.91 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.28 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  29.02 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.73 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  37.84 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.87 
 
 		 315 aa  161  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  32.69 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.18 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  39.29 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.68 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  34.39 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.93 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.5 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  37.02 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.71 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  37.79 
 
 		 320 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  37.79 
 
 		 320 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.9 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  36.57 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  36.53 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  40.18 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  37.62 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.53 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  35.1 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  36.44 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  36.7 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  37.5 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  35.02 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.36 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  37.66 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  38.46 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.81 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.29 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.13 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  32.16 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  33.92 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.23 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  39.23 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.76 
 
 		 303 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  35.75 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.56 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  35.16 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.44 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.65 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  29.57 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  38.97 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>