More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0869 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  50 
 
 
309 aa  305  7e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  50.93 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.45 
 
 
334 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  45.42 
 
 
334 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  44.95 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0903  ABC transporter related  45.28 
 
 
303 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  43.3 
 
 
338 aa  185  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  39.91 
 
 
252 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  42.41 
 
 
334 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3105  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.21 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3165  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.21 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337194  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  39.91 
 
 
316 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 
334 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.58 
 
 
345 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
251 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.52 
 
 
343 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1439  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
299 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  34.06 
 
 
330 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  41.23 
 
 
328 aa  169  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 
446 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.14 
 
 
374 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  39.82 
 
 
332 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.67 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.76 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.76 
 
 
322 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
338 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.28 
 
 
314 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.43 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  33.98 
 
 
329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.34 
 
 
243 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  35.28 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.41 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.05 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  43.19 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.33 
 
 
328 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  36.48 
 
 
243 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 
334 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1353  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101008  normal  0.136194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 
366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 
366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 
366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.56 
 
 
331 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  38.6 
 
 
241 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.52 
 
 
309 aa  162  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  38.2 
 
 
248 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 
316 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  38.81 
 
 
270 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  38.76 
 
 
257 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.94 
 
 
327 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
342 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 
248 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  33.8 
 
 
290 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1793  ABC transporter-like protein  40.83 
 
 
270 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 
351 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
323 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  38.84 
 
 
294 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.77 
 
 
312 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 
316 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 
308 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
356 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 
248 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1756  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.49 
 
 
334 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215273  hitchhiker  0.00900194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
348 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2708  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 
329 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  36 
 
 
305 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  40.34 
 
 
293 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
305 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 
449 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  38.63 
 
 
248 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  34.43 
 
 
288 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.73 
 
 
323 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  35.03 
 
 
338 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.33 
 
 
319 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  35.96 
 
 
326 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
359 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
332 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4511  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.65 
 
 
380 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.06 
 
 
308 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.08 
 
 
331 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 
411 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.86 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.35 
 
 
347 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.17 
 
 
323 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
380 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  37.94 
 
 
266 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  33.01 
 
 
316 aa  155  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 
325 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  38.12 
 
 
320 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  38.12 
 
 
320 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>