More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0605 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  100 
 
 
308 aa  610  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  74.67 
 
 
301 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  74.16 
 
 
356 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  69.02 
 
 
304 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  64.78 
 
 
391 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  65.33 
 
 
313 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  64.45 
 
 
316 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  63.64 
 
 
304 aa  351  8e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  61.95 
 
 
304 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.21 
 
 
323 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  44.81 
 
 
315 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  51.89 
 
 
318 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 
317 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.93 
 
 
317 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.6 
 
 
316 aa  182  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  38.69 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  43.24 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 
317 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
309 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  38.03 
 
 
310 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4550  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 
314 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.46 
 
 
236 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
312 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  37.12 
 
 
235 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  37.95 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  32.14 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  42.61 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  39.91 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  38 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.56 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
302 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.55 
 
 
298 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.85 
 
 
301 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  32.23 
 
 
313 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
313 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.1 
 
 
305 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
309 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.08 
 
 
334 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
318 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  41.13 
 
 
305 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
334 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  32.79 
 
 
339 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  31.65 
 
 
305 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 
307 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  36.58 
 
 
315 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
305 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.56 
 
 
303 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  36.36 
 
 
303 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 
309 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.28 
 
 
345 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.46 
 
 
308 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  32.57 
 
 
326 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 
279 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.56 
 
 
303 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  40.98 
 
 
326 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  33.75 
 
 
326 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
309 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  39.75 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.83 
 
 
299 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
303 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  28 
 
 
308 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.79 
 
 
331 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  31.79 
 
 
331 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  31.79 
 
 
303 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 
321 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 
331 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  31.79 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  37.04 
 
 
303 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
332 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 
327 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  33.54 
 
 
313 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  31.95 
 
 
309 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.55 
 
 
316 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
325 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.27 
 
 
292 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 
309 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.65 
 
 
301 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  36.48 
 
 
339 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 
303 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  33.88 
 
 
310 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.39 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  32.61 
 
 
266 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.22 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  37.39 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  32.13 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  36.39 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  30.98 
 
 
300 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  38.91 
 
 
316 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
308 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.89 
 
 
307 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.6 
 
 
332 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>