93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04393 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  100 
 
 		 218 aa  433  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  68.15 
 
 		 524 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  54.24 
 
 		 532 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  54.86 
 
 		 561 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  57.89 
 
 		 517 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  46.75 
 
 		 497 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  48 
 
 		 567 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  48 
 
 		 572 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  48.61 
 
 		 572 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 572 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  44.52 
 
 		 557 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  47.06 
 
 		 562 aa  99  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  37.9 
 
 		 1010 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  34.81 
 
 		 866 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  35.8 
 
 		 897 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.4 
 
 		 876 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 868 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  31.82 
 
 		 968 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  29.81 
 
 		 814 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  33.02 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  36.84 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  32.87 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  33.1 
 
 		 778 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  33.33 
 
 		 775 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  34.46 
 
 		 494 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.37 
 
 		 944 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  36.27 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  33.06 
 
 		 806 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  31.13 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  38.14 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  33.63 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  31.5 
 
 		 321 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  25.4 
 
 		 292 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.81 
 
 		 286 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  40.7 
 
 		 312 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  31.75 
 
 		 306 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.64 
 
 		 678 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.81 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  36.17 
 
 		 637 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.403131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  35.64 
 
 		 976 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  32.33 
 
 		 534 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  38.37 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2245  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  33.87 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.563783 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  33.71 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  32.99 
 
 		 854 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1126  peptidase S15  33.33 
 
 		 335 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  30.95 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  37.21 
 
 		 310 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  38.37 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  37.21 
 
 		 310 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  38.37 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  38.37 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  33.66 
 
 		 302 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  37.21 
 
 		 306 aa  45.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  37.21 
 
 		 306 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  37.21 
 
 		 306 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  37.21 
 
 		 306 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.66 
 
 		 317 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  33.04 
 
 		 320 aa  45.4  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  33.33 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  33.33 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.75 
 
 		 629 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  30.43 
 
 		 948 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.07 
 
 		 827 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 514 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  33.65 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  28.99 
 
 		 638 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  37.78 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.04 
 
 		 828 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  33.73 
 
 		 569 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 588 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  30 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32.94 
 
 		 467 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  37.08 
 
 		 615 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  32.73 
 
 		 668 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2277  peptidase S15  31.52 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.1 
 
 		 828 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34.07 
 
 		 307 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  31.78 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  28.33 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  32.73 
 
 		 668 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.07 
 
 		 831 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.25 
 
 		 648 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  28.28 
 
 		 949 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  28.3 
 
 		 402 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  28.3 
 
 		 402 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  31.07 
 
 		 824 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.64 
 
 		 632 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.97 
 
 		 626 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>