240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1556 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  99.48 
 
 
572 aa  1159    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  94.76 
 
 
572 aa  1118    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  99.47 
 
 
567 aa  1151    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  100 
 
 
572 aa  1164    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  41.05 
 
 
557 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  37.68 
 
 
497 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  35.82 
 
 
532 aa  263  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  34.74 
 
 
524 aa  260  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  33.4 
 
 
561 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  35.44 
 
 
517 aa  232  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  29.94 
 
 
562 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  48.61 
 
 
218 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  24.8 
 
 
897 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  26.25 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  27 
 
 
814 aa  84  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.43 
 
 
668 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.81 
 
 
668 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.71 
 
 
866 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  30.12 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  41 
 
 
876 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.31 
 
 
653 aa  72  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.59 
 
 
868 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.65 
 
 
667 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  34.21 
 
 
1010 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  23.84 
 
 
678 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  21.81 
 
 
576 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  24.38 
 
 
674 aa  63.9  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.82 
 
 
675 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  23.45 
 
 
677 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.17 
 
 
633 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  24.57 
 
 
775 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  34.35 
 
 
287 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.7 
 
 
678 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  22.05 
 
 
644 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.89 
 
 
550 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5138  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  25.34 
 
 
656 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  21.53 
 
 
679 aa  60.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  38.74 
 
 
968 aa  60.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  24.07 
 
 
806 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  32.84 
 
 
656 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3908  Xaa-Pro dipeptidyl-peptidase  23.76 
 
 
667 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135659  normal  0.218311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25 
 
 
714 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  22.64 
 
 
292 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.46 
 
 
467 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  24.16 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  22.78 
 
 
663 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  32.09 
 
 
656 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  30.35 
 
 
854 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  23.03 
 
 
677 aa  57.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  24.2 
 
 
668 aa  57.4  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  22.7 
 
 
540 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  25.09 
 
 
778 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.61 
 
 
686 aa  57  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3229  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.8 
 
 
656 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16048  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  24.59 
 
 
294 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.07 
 
 
642 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.55 
 
 
768 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.52 
 
 
665 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  28.95 
 
 
355 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.61 
 
 
570 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  20.94 
 
 
644 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  27.67 
 
 
607 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  25.81 
 
 
628 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.91 
 
 
604 aa  54.3  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  22 
 
 
668 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  20.62 
 
 
670 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.46 
 
 
309 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  29.1 
 
 
763 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.87 
 
 
629 aa  54.3  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  29.1 
 
 
763 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.91 
 
 
748 aa  54.3  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  23.33 
 
 
673 aa  53.9  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  24.59 
 
 
679 aa  53.9  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27540  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.24 
 
 
584 aa  53.9  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.71 
 
 
632 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0380  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  25.73 
 
 
725 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871447  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  20.21 
 
 
670 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.79 
 
 
765 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  22.12 
 
 
690 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  22.6 
 
 
670 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  24.71 
 
 
612 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  26.15 
 
 
451 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  21.43 
 
 
670 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.24 
 
 
944 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2891  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.96 
 
 
597 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.024928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  28.36 
 
 
763 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.23 
 
 
771 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  21.75 
 
 
595 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.79 
 
 
631 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1126  peptidase S15  25.38 
 
 
335 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.36 
 
 
760 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.1 
 
 
346 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  24.88 
 
 
302 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  23.56 
 
 
705 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.27 
 
 
750 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  23.24 
 
 
948 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.23 
 
 
767 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.91 
 
 
751 aa  50.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>