47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4077 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  100 
 
 
854 aa  1684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  40.86 
 
 
887 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  39.82 
 
 
775 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  39.5 
 
 
778 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  38.94 
 
 
806 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  36.82 
 
 
813 aa  354  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  37.17 
 
 
494 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  28.63 
 
 
897 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  35.61 
 
 
866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  28.21 
 
 
876 aa  126  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.71 
 
 
868 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  32.99 
 
 
948 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  28.51 
 
 
949 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3709  peptidase S15  37.44 
 
 
519 aa  105  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00862119  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
814 aa  102  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  29.21 
 
 
1010 aa  91.3  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
976 aa  70.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 
885 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  40.35 
 
 
561 aa  68.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  35.04 
 
 
532 aa  65.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.16 
 
 
944 aa  65.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  38.54 
 
 
968 aa  65.1  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  26.76 
 
 
567 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  26.76 
 
 
572 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.46 
 
 
572 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  72.5 
 
 
692 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  26.78 
 
 
572 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  21.95 
 
 
497 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  28.45 
 
 
524 aa  57.4  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  30.26 
 
 
557 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  35.51 
 
 
517 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.47 
 
 
557 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  42.17 
 
 
934 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.07 
 
 
1056 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  37.19 
 
 
746 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68475  predicted protein  32.94 
 
 
782 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  32.99 
 
 
218 aa  47  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  23.04 
 
 
562 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  30.84 
 
 
396 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  58.14 
 
 
701 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  58.14 
 
 
701 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  58.14 
 
 
701 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  46.15 
 
 
999 aa  44.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  46.15 
 
 
999 aa  44.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.33 
 
 
286 aa  44.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 
286 aa  44.3  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  46.15 
 
 
999 aa  44.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>