47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2538 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  100 
 
 
887 aa  1718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  41.76 
 
 
854 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  45.85 
 
 
806 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  45.88 
 
 
813 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  45.04 
 
 
775 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  45.44 
 
 
778 aa  429  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  42.27 
 
 
494 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  31.71 
 
 
897 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.31 
 
 
866 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.08 
 
 
876 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  37.37 
 
 
948 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
814 aa  127  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
868 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  32.6 
 
 
885 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3709  peptidase S15  33.6 
 
 
519 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00862119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.93 
 
 
944 aa  98.2  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  48.45 
 
 
1010 aa  95.1  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  50.88 
 
 
949 aa  93.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  43 
 
 
968 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  50 
 
 
976 aa  82.4  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  24.06 
 
 
561 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  27.67 
 
 
562 aa  67.8  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  27.08 
 
 
532 aa  67  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  30.03 
 
 
3378 aa  67  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 
934 aa  67  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  35.94 
 
 
557 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.21 
 
 
557 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  22.11 
 
 
567 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  22.11 
 
 
572 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  21.77 
 
 
572 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  28.45 
 
 
2310 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.16 
 
 
580 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  21.77 
 
 
572 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  29.71 
 
 
997 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  24.24 
 
 
517 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.55 
 
 
2816 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  31.85 
 
 
815 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1815  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.43 
 
 
653 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  23.87 
 
 
292 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  30 
 
 
299 aa  49.3  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  41 
 
 
692 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  25.11 
 
 
497 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  28.69 
 
 
2305 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  32.99 
 
 
218 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3566  hypothetical protein  26.6 
 
 
313 aa  45.8  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  32.98 
 
 
524 aa  45.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  29.32 
 
 
264 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>