141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0776 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  100 
 
 
517 aa  1002    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  51.68 
 
 
532 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  53.52 
 
 
561 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  48.82 
 
 
524 aa  425  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  41.51 
 
 
497 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.79 
 
 
557 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  34.87 
 
 
567 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  34.87 
 
 
572 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  34.87 
 
 
572 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 
572 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  33.73 
 
 
562 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  57.89 
 
 
218 aa  160  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  40.4 
 
 
1010 aa  83.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  41.61 
 
 
876 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  26.17 
 
 
868 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.97 
 
 
866 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  37.31 
 
 
968 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  27.43 
 
 
494 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  26.68 
 
 
897 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  23.52 
 
 
775 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  25.63 
 
 
286 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  25.63 
 
 
286 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  35.15 
 
 
814 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  36.52 
 
 
778 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  25.67 
 
 
612 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.96 
 
 
944 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  28.15 
 
 
309 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  36 
 
 
298 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  30.56 
 
 
309 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  26.57 
 
 
306 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.34 
 
 
678 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.36 
 
 
637 aa  57  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.403131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  30.11 
 
 
294 aa  57  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  25.4 
 
 
813 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  24.59 
 
 
806 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  26.04 
 
 
299 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  25 
 
 
668 aa  53.9  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  32.88 
 
 
648 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  35 
 
 
854 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  27.64 
 
 
360 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2667  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.38 
 
 
597 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.300273  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2860  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.38 
 
 
597 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.09 
 
 
326 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  32.33 
 
 
301 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  43.24 
 
 
948 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2865  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.38 
 
 
597 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  32.81 
 
 
304 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
976 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.15 
 
 
307 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.51 
 
 
298 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2618  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.18 
 
 
579 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2588  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.18 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.81 
 
 
629 aa  51.2  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  27.14 
 
 
360 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
514 aa  50.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 
250 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  25.84 
 
 
679 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.12 
 
 
292 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  47.37 
 
 
256 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 
588 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  25.47 
 
 
569 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  29.53 
 
 
632 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2664  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.86 
 
 
574 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  25.59 
 
 
615 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  31.11 
 
 
295 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  28.87 
 
 
306 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  27.78 
 
 
295 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  28.69 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  42.34 
 
 
949 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  33.09 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2908  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.18 
 
 
597 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2873  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.63 
 
 
579 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  27.12 
 
 
655 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.55 
 
 
634 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  30.89 
 
 
498 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.1 
 
 
706 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2245  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  32.61 
 
 
320 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.563783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2891  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.6 
 
 
597 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.024928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  25.89 
 
 
305 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  25.89 
 
 
355 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.06 
 
 
629 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
295 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.38 
 
 
626 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  25.64 
 
 
342 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  27.87 
 
 
298 aa  47  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.58 
 
 
641 aa  47  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 
591 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  31.86 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  33.64 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  22.74 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  27.41 
 
 
355 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.63 
 
 
642 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  27.33 
 
 
306 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  32.59 
 
 
293 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.5 
 
 
688 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  22.84 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  31.69 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  29.85 
 
 
296 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  25.75 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  26.55 
 
 
542 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>