159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3626 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  62.35 
 
 
532 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  100 
 
 
561 aa  1115    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  53.91 
 
 
517 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  47.57 
 
 
524 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  36.93 
 
 
497 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  37.42 
 
 
557 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  33.85 
 
 
572 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  33.85 
 
 
572 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  33.8 
 
 
567 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  33.67 
 
 
562 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
572 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  54.86 
 
 
218 aa  163  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  28.18 
 
 
897 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  25.59 
 
 
868 aa  93.6  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  29.76 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04392  hypothetical protein  46.34 
 
 
109 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  24.81 
 
 
775 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.69 
 
 
866 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.58 
 
 
876 aa  73.9  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  36.96 
 
 
1010 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  24.8 
 
 
814 aa  70.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.87 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  38.74 
 
 
778 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  26.26 
 
 
813 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.24 
 
 
944 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  26.1 
 
 
306 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  25.8 
 
 
571 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  40 
 
 
854 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
286 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  30 
 
 
292 aa  60.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30 
 
 
286 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  36.7 
 
 
806 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  33.82 
 
 
968 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  37.65 
 
 
467 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  25.93 
 
 
320 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.19 
 
 
259 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  24.47 
 
 
674 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.86 
 
 
629 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  22.99 
 
 
644 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2664  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.77 
 
 
574 aa  57  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197221  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  26.85 
 
 
298 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.28 
 
 
550 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.47 
 
 
634 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  32.31 
 
 
297 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.08 
 
 
678 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  25.45 
 
 
300 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.6 
 
 
622 aa  55.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3908  Xaa-Pro dipeptidyl-peptidase  24.85 
 
 
667 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135659  normal  0.218311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  41.24 
 
 
976 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  30.89 
 
 
298 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  35.38 
 
 
287 aa  53.9  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.05 
 
 
570 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2891  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.68 
 
 
597 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.024928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  30.08 
 
 
309 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.8 
 
 
642 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  25 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  29.69 
 
 
735 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  26.28 
 
 
655 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  32.99 
 
 
295 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.35 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2588  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.77 
 
 
597 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  34.45 
 
 
318 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  25.34 
 
 
298 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  19.84 
 
 
636 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  22.8 
 
 
569 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.62 
 
 
648 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  29.79 
 
 
306 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2667  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.36 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.300273  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2860  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.36 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  34.85 
 
 
326 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  27.88 
 
 
345 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.43 
 
 
645 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2865  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.36 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  24.55 
 
 
319 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  24.9 
 
 
887 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1126  peptidase S15  25.68 
 
 
335 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2908  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.47 
 
 
597 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.57 
 
 
631 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.59 
 
 
631 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36 
 
 
667 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  29.08 
 
 
306 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2618  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  21.34 
 
 
579 aa  50.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.8 
 
 
545 aa  50.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  28.12 
 
 
384 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  28.08 
 
 
316 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  29.69 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 
321 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.05 
 
 
645 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  24.09 
 
 
319 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  23.64 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2108  peptidase S15  31.14 
 
 
782 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  25.33 
 
 
299 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.85 
 
 
812 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  23.04 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  31.3 
 
 
386 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  24.37 
 
 
678 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.05 
 
 
645 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.37 
 
 
607 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  33.66 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.05 
 
 
645 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>