40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5180 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  68.62 
 
 
676 aa  820    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  100 
 
 
692 aa  1398    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  36.88 
 
 
701 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  36.88 
 
 
701 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  36.88 
 
 
701 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  33.38 
 
 
680 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  33.33 
 
 
676 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  33.33 
 
 
676 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  42.35 
 
 
503 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  41.73 
 
 
438 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  42.48 
 
 
300 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  42.48 
 
 
300 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  37.13 
 
 
429 aa  216  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  35.47 
 
 
357 aa  180  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  35.47 
 
 
606 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  32.9 
 
 
502 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  30.65 
 
 
328 aa  137  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  32.1 
 
 
386 aa  110  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.14 
 
 
2816 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  32.99 
 
 
885 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  42.98 
 
 
775 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.26 
 
 
2310 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  32.56 
 
 
778 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  72.5 
 
 
854 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.07 
 
 
2305 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  36.53 
 
 
557 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  29.12 
 
 
1039 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  28.65 
 
 
3378 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  27.31 
 
 
371 aa  55.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.84 
 
 
2114 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  34.45 
 
 
3521 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  33.61 
 
 
3471 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  29.93 
 
 
489 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  33.61 
 
 
3472 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  27.45 
 
 
484 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.42 
 
 
1056 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  44.44 
 
 
887 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  29.21 
 
 
444 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5061  hypothetical protein  39.44 
 
 
284 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1940  hypothetical protein  28.64 
 
 
660 aa  44.3  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>