45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5004 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  100 
 
 		 1039 aa  2028    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  37.24 
 
 		 746 aa  260  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.68 
 
 		 1949 aa  154  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  30.93 
 
 		 666 aa  129  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  45.62 
 
 		 567 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.75 
 
 		 1063 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.82 
 
 		 777 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.09 
 
 		 802 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.9 
 
 		 1067 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.27 
 
 		 1056 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  32.13 
 
 		 885 aa  78.2  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.08 
 
 		 3927 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  31.82 
 
 		 3378 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  32.13 
 
 		 815 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  30.89 
 
 		 2305 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.44 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.86 
 
 		 1433 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.76 
 
 		 2377 aa  62  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  28.08 
 
 		 692 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  31.15 
 
 		 1597 aa  58.5  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.32 
 
 		 1884 aa  58.2  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  29.52 
 
 		 997 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.15 
 
 		 2310 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.27 
 
 		 1215 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  30.27 
 
 		 1215 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.01 
 
 		 2114 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  32.04 
 
 		 1867 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  31.35 
 
 		 1215 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  31.35 
 
 		 1215 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1066 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2591  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1188 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225113  normal  0.278205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.63 
 
 		 4978 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30.48 
 
 		 1706 aa  50.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  29.23 
 
 		 854 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  32.02 
 
 		 1428 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.11 
 
 		 892 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 3363 aa  48.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  45.56 
 
 		 934 aa  46.2  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.79 
 
 		 2816 aa  45.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.6 
 
 		 2507 aa  45.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  28.19 
 
 		 887 aa  45.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  38.55 
 
 		 693 aa  45.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  28.44 
 
 		 1712 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  37.21 
 
 		 898 aa  44.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.95 
 
 		 2839 aa  44.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>