More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4855 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
2114 aa  4177    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  40.52 
 
 
1597 aa  318  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.81 
 
 
5745 aa  317  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.46 
 
 
4978 aa  285  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.92 
 
 
1884 aa  258  7e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.1 
 
 
3191 aa  258  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.7 
 
 
2816 aa  250  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  36.76 
 
 
1269 aa  241  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  37.23 
 
 
1269 aa  238  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  37.21 
 
 
1268 aa  235  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.8 
 
 
994 aa  231  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  34.26 
 
 
1367 aa  226  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35.02 
 
 
3474 aa  224  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.96 
 
 
3927 aa  224  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.05 
 
 
4848 aa  214  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  35.91 
 
 
721 aa  213  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.6 
 
 
892 aa  211  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.37 
 
 
2839 aa  209  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.44 
 
 
2377 aa  207  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  33.55 
 
 
1363 aa  206  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  32.67 
 
 
1706 aa  201  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  40.54 
 
 
1512 aa  201  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.39 
 
 
2074 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.63 
 
 
2767 aa  194  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  33.29 
 
 
2555 aa  184  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.73 
 
 
850 aa  183  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.67 
 
 
3477 aa  182  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.87 
 
 
4220 aa  172  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.83 
 
 
3816 aa  171  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.88 
 
 
3363 aa  162  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  34.27 
 
 
814 aa  157  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  37.69 
 
 
1416 aa  154  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  38.53 
 
 
2807 aa  147  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.75 
 
 
761 aa  145  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  35.15 
 
 
1867 aa  140  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  33.27 
 
 
1428 aa  139  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30.16 
 
 
16322 aa  135  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.86 
 
 
9867 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.96 
 
 
4836 aa  129  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.69 
 
 
4122 aa  120  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.62 
 
 
2812 aa  120  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.3 
 
 
4854 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.48 
 
 
2353 aa  110  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.93 
 
 
369 aa  107  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.39 
 
 
2153 aa  107  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.62 
 
 
3089 aa  104  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.45 
 
 
1109 aa  104  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  31.08 
 
 
1422 aa  103  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.84 
 
 
7284 aa  103  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.02 
 
 
689 aa  103  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  42.92 
 
 
1502 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  39.57 
 
 
1911 aa  103  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.22 
 
 
2507 aa  102  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.53 
 
 
1066 aa  102  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  36.64 
 
 
1094 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.98 
 
 
5787 aa  101  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.86 
 
 
354 aa  100  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  40.48 
 
 
354 aa  100  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  40.45 
 
 
715 aa  99.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.07 
 
 
354 aa  98.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  32.05 
 
 
4791 aa  98.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  29.87 
 
 
1061 aa  97.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  33.64 
 
 
722 aa  97.1  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  31.75 
 
 
1215 aa  97.1  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  31.75 
 
 
1215 aa  96.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  34.46 
 
 
335 aa  96.3  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.06 
 
 
1215 aa  95.9  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  25.45 
 
 
2056 aa  95.9  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.82 
 
 
8321 aa  95.5  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  34.48 
 
 
391 aa  95.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  34.69 
 
 
663 aa  95.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  28.74 
 
 
1408 aa  94.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  28.74 
 
 
1410 aa  94.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  28.74 
 
 
1410 aa  94.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  32.96 
 
 
5442 aa  94.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.43 
 
 
1215 aa  93.2  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  31.43 
 
 
1215 aa  93.2  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  37.5 
 
 
2503 aa  91.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  38.04 
 
 
3699 aa  91.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.18 
 
 
810 aa  90.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  37.5 
 
 
2476 aa  90.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  32.31 
 
 
5769 aa  90.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.89 
 
 
3544 aa  89  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  33.21 
 
 
332 aa  88.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.41 
 
 
3699 aa  88.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.12 
 
 
1667 aa  89  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  33.94 
 
 
4285 aa  88.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.64 
 
 
2768 aa  88.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  40.29 
 
 
891 aa  86.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.16 
 
 
366 aa  86.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.81 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.24 
 
 
4798 aa  85.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.78 
 
 
2522 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.43 
 
 
819 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 
885 aa  84.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.85 
 
 
1712 aa  84.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.02 
 
 
5839 aa  84  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  26.11 
 
 
2011 aa  83.6  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.84 
 
 
415 aa  83.2  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  27.46 
 
 
2084 aa  83.2  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>