More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1566 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 1712 aa  3326    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  66.67 
 
 		 2775 aa  497  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.33 
 
 		 1236 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  56.83 
 
 		 2667 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  60.18 
 
 		 2885 aa  340  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.32 
 
 		 2105 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.97 
 
 		 1795 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.61 
 
 		 1424 aa  212  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  36.76 
 
 		 526 aa  201  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.82 
 
 		 980 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.02 
 
 		 3619 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.86 
 
 		 3619 aa  198  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.51 
 
 		 1287 aa  193  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.22 
 
 		 2954 aa  192  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 1079 aa  191  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.96 
 
 		 946 aa  190  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.4 
 
 		 2911 aa  186  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.79 
 
 		 1534 aa  184  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  36.75 
 
 		 3608 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  42.46 
 
 		 615 aa  181  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.67 
 
 		 2678 aa  181  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.22 
 
 		 460 aa  181  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.67 
 
 		 3427 aa  179  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.72 
 
 		 1164 aa  177  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.32 
 
 		 1279 aa  176  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.42 
 
 		 341 aa  175  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.43 
 
 		 1532 aa  175  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.8 
 
 		 2668 aa  172  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.71 
 
 		 833 aa  172  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  38.41 
 
 		 686 aa  172  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  34.84 
 
 		 769 aa  169  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  39.48 
 
 		 341 aa  165  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.21 
 
 		 556 aa  162  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  35.77 
 
 		 1544 aa  159  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.54 
 
 		 1895 aa  159  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.14 
 
 		 1016 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  38.55 
 
 		 595 aa  159  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.53 
 
 		 1390 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  37.28 
 
 		 437 aa  157  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.22 
 
 		 1883 aa  156  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  34.01 
 
 		 860 aa  155  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  38.73 
 
 		 1855 aa  154  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  42.42 
 
 		 460 aa  154  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  37.1 
 
 		 745 aa  154  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 907 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  43.61 
 
 		 4687 aa  154  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  34.84 
 
 		 363 aa  153  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  36.08 
 
 		 1499 aa  152  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.37 
 
 		 4334 aa  152  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  32.99 
 
 		 2836 aa  152  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  36.83 
 
 		 437 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.06 
 
 		 3209 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.26 
 
 		 1363 aa  150  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  37.56 
 
 		 1400 aa  149  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.92 
 
 		 795 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36.13 
 
 		 1197 aa  148  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.75 
 
 		 9867 aa  148  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.38 
 
 		 260 aa  148  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  37.38 
 
 		 1884 aa  147  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  33.2 
 
 		 1072 aa  146  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.78 
 
 		 588 aa  145  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.75 
 
 		 2145 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  35.24 
 
 		 959 aa  144  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  35.81 
 
 		 734 aa  143  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 		 982 aa  143  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.83 
 
 		 202 aa  142  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  44.83 
 
 		 202 aa  142  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.81 
 
 		 1156 aa  141  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.78 
 
 		 3954 aa  140  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  40.51 
 
 		 2097 aa  141  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  37.89 
 
 		 2689 aa  140  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.59 
 
 		 1145 aa  140  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  36.97 
 
 		 741 aa  139  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 589 aa  135  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.39 
 
 		 833 aa  134  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  34.66 
 
 		 1582 aa  134  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.97 
 
 		 824 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  47.51 
 
 		 219 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  38.51 
 
 		 613 aa  132  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  33.95 
 
 		 965 aa  131  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  35.08 
 
 		 393 aa  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.59 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.23 
 
 		 1480 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 4800 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.26 
 
 		 5745 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  43.78 
 
 		 709 aa  129  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  34.97 
 
 		 491 aa  129  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  40.52 
 
 		 606 aa  129  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  31.19 
 
 		 1383 aa  128  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  37.92 
 
 		 648 aa  127  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.28 
 
 		 820 aa  127  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  41.9 
 
 		 728 aa  126  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  36.24 
 
 		 475 aa  126  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 		 243 aa  126  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  45.99 
 
 		 219 aa  126  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  36.68 
 
 		 757 aa  125  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  35.07 
 
 		 2133 aa  125  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  34.22 
 
 		 1421 aa  125  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  43.32 
 
 		 357 aa  125  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  39.71 
 
 		 245 aa  125  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>