More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4802 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
907 aa  1805    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  57.95 
 
 
608 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  43.92 
 
 
465 aa  365  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  41.47 
 
 
475 aa  348  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  39.42 
 
 
686 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
2198 aa  313  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  49.87 
 
 
2954 aa  311  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  49.6 
 
 
2807 aa  310  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  48.91 
 
 
2467 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  48.85 
 
 
2133 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.18 
 
 
1415 aa  295  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  44.42 
 
 
3954 aa  262  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  41.45 
 
 
3209 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  41.36 
 
 
395 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  41.38 
 
 
395 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  40.6 
 
 
851 aa  229  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  42.54 
 
 
1764 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  44.57 
 
 
320 aa  210  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.07 
 
 
1029 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  48.07 
 
 
1029 aa  207  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  44.08 
 
 
768 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  41.46 
 
 
1133 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  39.32 
 
 
1134 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 
427 aa  197  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 
306 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.16 
 
 
4334 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  40.43 
 
 
3608 aa  179  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.44 
 
 
820 aa  175  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
1855 aa  172  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 
1610 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.47 
 
 
3619 aa  168  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.64 
 
 
3619 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  44.4 
 
 
1534 aa  165  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  43.6 
 
 
1532 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  42.81 
 
 
2097 aa  162  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.28 
 
 
1197 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  38.53 
 
 
462 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  40 
 
 
3026 aa  157  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.81 
 
 
824 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  37.69 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  40.64 
 
 
503 aa  151  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 
503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  40.59 
 
 
1610 aa  148  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.92 
 
 
2105 aa  147  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.64 
 
 
2775 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.03 
 
 
2667 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 
475 aa  135  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.74 
 
 
1795 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  31.89 
 
 
475 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.69 
 
 
1712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.06 
 
 
1019 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  33.5 
 
 
883 aa  126  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.51 
 
 
1236 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.36 
 
 
2911 aa  125  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.74 
 
 
727 aa  125  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 
1321 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.74 
 
 
1582 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  35.89 
 
 
2950 aa  118  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  39.05 
 
 
283 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 
615 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.83 
 
 
574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  34.16 
 
 
2885 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 
448 aa  110  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.42 
 
 
1079 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4916  hemolysin-type calcium-binding region  34.27 
 
 
452 aa  110  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  31.27 
 
 
276 aa  108  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  30.52 
 
 
526 aa  107  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.43 
 
 
686 aa  107  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.33 
 
 
980 aa  107  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  31.62 
 
 
1544 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.96 
 
 
1145 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  41.71 
 
 
546 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  28.17 
 
 
486 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  32.35 
 
 
460 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  35.36 
 
 
301 aa  104  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.78 
 
 
252 aa  104  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 
1628 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.67 
 
 
288 aa  103  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.99 
 
 
946 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  29.32 
 
 
281 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  31.56 
 
 
341 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.89 
 
 
2701 aa  102  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 
277 aa  102  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 
202 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.54 
 
 
202 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  32.63 
 
 
1213 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.64 
 
 
282 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.67 
 
 
423 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  37.62 
 
 
1557 aa  100  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  30.45 
 
 
288 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.27 
 
 
1037 aa  99.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 
694 aa  99.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  35.43 
 
 
289 aa  99.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.02 
 
 
633 aa  98.6  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  31.18 
 
 
279 aa  98.2  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  43.71 
 
 
535 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  30.2 
 
 
363 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.98 
 
 
1390 aa  96.3  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  30.68 
 
 
842 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.05 
 
 
745 aa  96.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>