More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0162 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 
833 aa  1528    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  44.5 
 
 
1390 aa  505  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  39.31 
 
 
1145 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  37.85 
 
 
2911 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  34.75 
 
 
4800 aa  307  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  35.99 
 
 
1884 aa  294  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 
1544 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 
1628 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.32 
 
 
1079 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  33.04 
 
 
1582 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  36.59 
 
 
1213 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  34.23 
 
 
1072 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  33.85 
 
 
2836 aa  232  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 
2097 aa  229  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  36.42 
 
 
764 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.35 
 
 
3954 aa  188  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  32.02 
 
 
1400 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 
4334 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  38.71 
 
 
745 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.29 
 
 
1855 aa  172  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.04 
 
 
1415 aa  171  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.93 
 
 
2467 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.35 
 
 
1286 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  33.58 
 
 
2807 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.83 
 
 
1156 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.64 
 
 
1279 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  36.29 
 
 
1112 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.79 
 
 
1363 aa  158  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  35.36 
 
 
556 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  51.56 
 
 
759 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.47 
 
 
2678 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  31.12 
 
 
1112 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31 
 
 
1499 aa  145  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.18 
 
 
946 aa  144  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  30.94 
 
 
2133 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.43 
 
 
965 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.41 
 
 
1895 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.58 
 
 
4687 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.25 
 
 
1236 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.37 
 
 
824 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  38.36 
 
 
648 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.2 
 
 
2775 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.69 
 
 
833 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  29.26 
 
 
1764 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.75 
 
 
1534 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  38.3 
 
 
795 aa  127  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.59 
 
 
2954 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.41 
 
 
820 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  42.45 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  34.06 
 
 
2198 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.35 
 
 
3427 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  29.85 
 
 
1134 aa  114  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  35.31 
 
 
1424 aa  114  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  28.8 
 
 
3209 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  34.03 
 
 
1532 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.62 
 
 
3619 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  29.09 
 
 
2667 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  43.78 
 
 
813 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  37.5 
 
 
1164 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.33 
 
 
3619 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.3 
 
 
1712 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.45 
 
 
2145 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.67 
 
 
3608 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  37.58 
 
 
2950 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  32.74 
 
 
595 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.18 
 
 
1795 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  27.28 
 
 
1480 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  27.65 
 
 
860 aa  105  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  39.18 
 
 
850 aa  105  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  36.02 
 
 
1610 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.37 
 
 
950 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.79 
 
 
980 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.18 
 
 
2105 aa  102  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  37.2 
 
 
709 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  41.82 
 
 
1971 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  31.24 
 
 
851 aa  101  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.09 
 
 
588 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  47.71 
 
 
686 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.36 
 
 
421 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  30.84 
 
 
559 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  49.65 
 
 
677 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  36.3 
 
 
526 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  37.71 
 
 
393 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  39.61 
 
 
982 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  54.31 
 
 
606 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.72 
 
 
1287 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  28.96 
 
 
1133 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.81 
 
 
2668 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  33.42 
 
 
769 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  35.36 
 
 
615 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.37 
 
 
1197 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  29.45 
 
 
387 aa  96.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  34.05 
 
 
589 aa  96.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  39.56 
 
 
9867 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  37.76 
 
 
437 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.34 
 
 
1963 aa  94.7  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.95 
 
 
613 aa  94.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  53.98 
 
 
202 aa  94.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  53.98 
 
 
202 aa  94.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  33.19 
 
 
260 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>