More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3182 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  99.28 
 
 		 556 aa  1048    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  99.44 
 
 		 2060 aa  3751    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2678 aa  5207    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  43.04 
 
 		 3132 aa  544  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  44.24 
 
 		 2911 aa  333  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  41.42 
 
 		 1079 aa  295  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  38.08 
 
 		 946 aa  257  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  45.23 
 
 		 1884 aa  251  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.66 
 
 		 2775 aa  238  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.76 
 
 		 1279 aa  235  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.72 
 
 		 1795 aa  226  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 		 9867 aa  217  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.94 
 
 		 1363 aa  215  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.22 
 
 		 2954 aa  213  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  36.28 
 
 		 1544 aa  211  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  39.16 
 
 		 4800 aa  207  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 		 1534 aa  207  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  38.82 
 
 		 595 aa  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  34.47 
 
 		 1532 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.46 
 
 		 1156 aa  199  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  36.3 
 
 		 1499 aa  199  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.96 
 
 		 4334 aa  196  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  37.55 
 
 		 1400 aa  195  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 		 3954 aa  191  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 		 2836 aa  191  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  38.04 
 
 		 3619 aa  189  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.32 
 
 		 3619 aa  189  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.03 
 
 		 1424 aa  187  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  37.72 
 
 		 965 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  38.14 
 
 		 745 aa  184  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.87 
 
 		 2105 aa  180  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.84 
 
 		 3608 aa  179  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 2097 aa  179  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.66 
 
 		 2667 aa  178  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  37.88 
 
 		 824 aa  175  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 1415 aa  169  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  37.68 
 
 		 1895 aa  168  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.67 
 
 		 1145 aa  168  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.4 
 
 		 1164 aa  167  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.53 
 
 		 795 aa  166  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.83 
 
 		 833 aa  161  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.35 
 
 		 3209 aa  160  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33.39 
 
 		 1855 aa  160  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  31.69 
 
 		 764 aa  159  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.61 
 
 		 2807 aa  159  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.24 
 
 		 980 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.41 
 
 		 1236 aa  156  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  39.73 
 
 		 4687 aa  154  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  33.93 
 
 		 1072 aa  153  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  34.8 
 
 		 1712 aa  152  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.79 
 
 		 1390 aa  150  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.64 
 
 		 1287 aa  150  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  34.63 
 
 		 1582 aa  149  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  37.31 
 
 		 393 aa  149  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  35.82 
 
 		 613 aa  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.93 
 
 		 820 aa  148  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  30.3 
 
 		 860 aa  147  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.86 
 
 		 833 aa  146  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.38 
 
 		 3427 aa  146  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  32.53 
 
 		 1286 aa  145  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  34.95 
 
 		 1628 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.67 
 
 		 526 aa  144  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  31.55 
 
 		 1864 aa  144  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.56 
 
 		 3598 aa  143  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  35.03 
 
 		 648 aa  142  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  35.99 
 
 		 2145 aa  142  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  31.36 
 
 		 2133 aa  141  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  29.17 
 
 		 2950 aa  139  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 363 aa  139  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  36.86 
 
 		 615 aa  139  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.91 
 
 		 2689 aa  136  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 		 357 aa  136  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.87 
 
 		 387 aa  136  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.43 
 
 		 982 aa  136  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  35.6 
 
 		 1112 aa  135  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  42.79 
 
 		 491 aa  134  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  30.62 
 
 		 1814 aa  134  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.94 
 
 		 4723 aa  134  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.33 
 
 		 1197 aa  133  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.16 
 
 		 460 aa  133  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  34.3 
 
 		 2198 aa  133  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  32.36 
 
 		 1383 aa  132  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  31.01 
 
 		 1112 aa  132  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  30.73 
 
 		 589 aa  132  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.76 
 
 		 2467 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  37.96 
 
 		 2001 aa  131  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.61 
 
 		 588 aa  131  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.09 
 
 		 1480 aa  130  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  37.97 
 
 		 341 aa  129  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1306 aa  129  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.96 
 
 		 387 aa  129  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.86 
 
 		 2107 aa  129  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  37.2 
 
 		 942 aa  129  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  36.15 
 
 		 850 aa  127  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  41.73 
 
 		 589 aa  128  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.28 
 
 		 2668 aa  128  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  32.11 
 
 		 769 aa  128  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  32.62 
 
 		 2127 aa  127  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.34 
 
 		 437 aa  127  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.43 
 
 		 1883 aa  125  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>