105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3540 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  100 
 
 		 2060 aa  4059    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  99.44 
 
 		 2678 aa  3749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  43.88 
 
 		 3132 aa  548  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  37.73 
 
 		 2001 aa  131  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  32.74 
 
 		 1021 aa  127  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  32.62 
 
 		 2127 aa  127  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  41.15 
 
 		 3714 aa  119  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.8 
 
 		 6678 aa  110  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  29.3 
 
 		 16311 aa  107  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  42.26 
 
 		 4231 aa  102  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  36.57 
 
 		 3508 aa  101  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  42.13 
 
 		 5769 aa  100  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  35.63 
 
 		 991 aa  97.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.96 
 
 		 1553 aa  94.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  28.21 
 
 		 2784 aa  91.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  36.63 
 
 		 998 aa  90.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  36.08 
 
 		 1143 aa  89.4  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  35.96 
 
 		 5094 aa  87.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  38.81 
 
 		 2132 aa  87.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  33.82 
 
 		 3229 aa  84  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  34.66 
 
 		 1055 aa  81.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  31.63 
 
 		 5218 aa  81.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  31.73 
 
 		 3182 aa  80.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  42.14 
 
 		 2337 aa  80.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  28.03 
 
 		 4661 aa  79  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  32.99 
 
 		 7284 aa  77.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  33.1 
 
 		 4285 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  41.33 
 
 		 1728 aa  76.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.19 
 
 		 5020 aa  75.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  30.65 
 
 		 2461 aa  75.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.87 
 
 		 2067 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.08 
 
 		 9867 aa  74.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  33.94 
 
 		 7149 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  33.43 
 
 		 2555 aa  72.8  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  29.41 
 
 		 2145 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  31.49 
 
 		 3259 aa  72  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 2507 aa  70.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  29.45 
 
 		 3091 aa  70.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.41 
 
 		 8871 aa  68.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  26.12 
 
 		 912 aa  68.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.91 
 
 		 3363 aa  68.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.42 
 
 		 3038 aa  68.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.25 
 
 		 3191 aa  68.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 		 1884 aa  68.6  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.86 
 
 		 2377 aa  68.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  33.33 
 
 		 4854 aa  65.9  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.35 
 
 		 5962 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.99 
 
 		 5098 aa  61.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  30.81 
 
 		 2567 aa  61.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.09 
 
 		 1706 aa  60.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  35.09 
 
 		 2336 aa  60.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.59 
 
 		 2812 aa  59.7  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  34.31 
 
 		 6276 aa  59.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  34.16 
 
 		 2715 aa  59.3  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 		 4748 aa  58.9  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  28.17 
 
 		 2887 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.52 
 
 		 3026 aa  57.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.54 
 
 		 1597 aa  56.2  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  39.37 
 
 		 2853 aa  56.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.03 
 
 		 4978 aa  55.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14743  predicted protein  29.38 
 
 		 1900 aa  55.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  36.49 
 
 		 8682 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  33.58 
 
 		 3066 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 1757 aa  55.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.54 
 
 		 11716 aa  54.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.5 
 
 		 2816 aa  54.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  36.49 
 
 		 9030 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.35 
 
 		 2839 aa  54.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.3 
 
 		 14916 aa  53.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  29.19 
 
 		 2345 aa  53.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  37.72 
 
 		 1586 aa  53.5  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.62 
 
 		 1599 aa  53.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  30 
 
 		 3758 aa  52.8  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  36.55 
 
 		 2542 aa  52.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  29.63 
 
 		 1883 aa  51.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.48 
 
 		 2239 aa  52  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1350 aa  51.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.81 
 
 		 3816 aa  51.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 		 1867 aa  50.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  40.85 
 
 		 2524 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  34.31 
 
 		 2836 aa  50.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  26.87 
 
 		 2743 aa  50.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 369 aa  49.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.41 
 
 		 2074 aa  49.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  33.78 
 
 		 6753 aa  49.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  32.12 
 
 		 1428 aa  49.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.81 
 
 		 8321 aa  48.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.3 
 
 		 3598 aa  48.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.61 
 
 		 3699 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1806 aa  48.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  27.61 
 
 		 2924 aa  48.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  27.49 
 
 		 1598 aa  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  39.06 
 
 		 277 aa  48.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  24.3 
 
 		 2767 aa  47.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  37.97 
 
 		 4214 aa  47.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  33.19 
 
 		 2807 aa  47  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  26.94 
 
 		 3477 aa  46.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.1 
 
 		 1215 aa  46.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.1 
 
 		 1215 aa  46.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>