173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0306 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  99.12 
 
 		 1806 aa  1368    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 1350 aa  2590    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  39.27 
 
 		 2887 aa  233  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2514  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1338 aa  204  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.482262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  65.09 
 
 		 1166 aa  192  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 2524 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  33.98 
 
 		 16311 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  29.44 
 
 		 2784 aa  112  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  35.65 
 
 		 4748 aa  111  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  30.46 
 
 		 3714 aa  103  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  32.05 
 
 		 3229 aa  101  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  29.17 
 
 		 3182 aa  99.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.12 
 
 		 1553 aa  99  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  40 
 
 		 1699 aa  97.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.94 
 
 		 4854 aa  96.3  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.19 
 
 		 1883 aa  93.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  40.79 
 
 		 1428 aa  91.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.21 
 
 		 1599 aa  88.6  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.34 
 
 		 1884 aa  87.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.33 
 
 		 3038 aa  87  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.71 
 
 		 2067 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  26.25 
 
 		 4661 aa  85.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.77 
 
 		 5020 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.11 
 
 		 3508 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  41.36 
 
 		 3184 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.26 
 
 		 1706 aa  82.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.86 
 
 		 4122 aa  79.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.96 
 
 		 5745 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  44.53 
 
 		 2305 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.61 
 
 		 4978 aa  78.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30.87 
 
 		 4791 aa  78.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  39.26 
 
 		 2768 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  40.14 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  28.01 
 
 		 3259 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 		 3396 aa  76.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.16 
 
 		 1597 aa  76.3  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.68 
 
 		 3314 aa  76.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  36.08 
 
 		 8321 aa  75.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  43.51 
 
 		 2310 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.73 
 
 		 3191 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.36 
 
 		 1269 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.53 
 
 		 5962 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  39.52 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1311  hypothetical protein  39.01 
 
 		 618 aa  70.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0843987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.64 
 
 		 1800 aa  70.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  34.46 
 
 		 2704 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  37.59 
 
 		 5444 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.15 
 
 		 1728 aa  68.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  30.84 
 
 		 2060 aa  68.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.24 
 
 		 2239 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.74 
 
 		 5218 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  40.71 
 
 		 9030 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  40.71 
 
 		 8682 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  35.87 
 
 		 2251 aa  68.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.35 
 
 		 5442 aa  66.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  36.88 
 
 		 2542 aa  66.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  35.88 
 
 		 2537 aa  65.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  39.83 
 
 		 6753 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.71 
 
 		 2812 aa  65.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  26.96 
 
 		 2337 aa  65.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  28.74 
 
 		 3477 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.43 
 
 		 4220 aa  64.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.79 
 
 		 4106 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  35.96 
 
 		 7284 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.82 
 
 		 1661 aa  63.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  49.41 
 
 		 16322 aa  63.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.61 
 
 		 2678 aa  63.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  38.26 
 
 		 2452 aa  64.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.42 
 
 		 5787 aa  63.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  42.59 
 
 		 4285 aa  62.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 1037 aa  62.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  36.96 
 
 		 1053 aa  62.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  28.27 
 
 		 6211 aa  62  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  38.26 
 
 		 2890 aa  62  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.85 
 
 		 3816 aa  62  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  38.52 
 
 		 4678 aa  62  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.62 
 
 		 1113 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.06 
 
 		 5839 aa  61.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  39.26 
 
 		 4214 aa  60.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  34.73 
 
 		 6678 aa  59.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  41.28 
 
 		 6662 aa  59.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  27.84 
 
 		 5123 aa  59.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  41.28 
 
 		 6779 aa  59.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.28 
 
 		 6683 aa  59.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  40 
 
 		 3026 aa  59.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  47.13 
 
 		 7149 aa  59.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  28.5 
 
 		 814 aa  58.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 		 1598 aa  58.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  26.84 
 
 		 7233 aa  58.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  39.02 
 
 		 2336 aa  56.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1313  hypothetical protein  32.19 
 
 		 2202 aa  55.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1512 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1073 aa  55.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.91 
 
 		 889 aa  55.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  35.09 
 
 		 5080 aa  55.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  26.4 
 
 		 3263 aa  55.5  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.13 
 
 		 2816 aa  55.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  31.93 
 
 		 1268 aa  55.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.4 
 
 		 1118 aa  55.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 		 6006 aa  55.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>