86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1662 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  50.92 
 
 
2825 aa  1603    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.17 
 
 
4876 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 
7233 aa  3033    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  48.85 
 
 
5009 aa  3243    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  31.02 
 
 
7919 aa  937    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  100 
 
 
6006 aa  11460    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  31.24 
 
 
6211 aa  637  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  54.8 
 
 
4748 aa  584  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  30 
 
 
5123 aa  478  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  37.22 
 
 
1232 aa  356  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  28.34 
 
 
5769 aa  307  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  32.26 
 
 
2887 aa  227  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  39.67 
 
 
3184 aa  218  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  30.01 
 
 
3263 aa  184  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  33.56 
 
 
1598 aa  174  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  32.75 
 
 
1867 aa  169  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.3 
 
 
2812 aa  115  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  29.63 
 
 
2127 aa  112  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  31.86 
 
 
2478 aa  105  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 
2452 aa  99.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  26.74 
 
 
2159 aa  82.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.69 
 
 
824 aa  79  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.48 
 
 
3038 aa  75.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.36 
 
 
3396 aa  75.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  26.06 
 
 
2743 aa  72.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.26 
 
 
3314 aa  72.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29.67 
 
 
4854 aa  70.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  37.36 
 
 
1538 aa  68.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.32 
 
 
3954 aa  65.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.09 
 
 
1855 aa  63.9  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  33.14 
 
 
1141 aa  63.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.8 
 
 
5098 aa  63.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.39 
 
 
2807 aa  62.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.54 
 
 
4220 aa  59.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.43 
 
 
16311 aa  59.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.05 
 
 
4334 aa  58.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  34.91 
 
 
7679 aa  58.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 
2524 aa  57.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  27.48 
 
 
2336 aa  57  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  32.49 
 
 
2329 aa  55.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.61 
 
 
7149 aa  55.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  37.3 
 
 
867 aa  54.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  39.18 
 
 
2768 aa  54.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  26.75 
 
 
3333 aa  53.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  42.22 
 
 
572 aa  53.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
686 aa  53.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.96 
 
 
2507 aa  53.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  25.44 
 
 
2890 aa  52.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  24.97 
 
 
3259 aa  52.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 
2537 aa  52.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 
1895 aa  52.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  31.98 
 
 
940 aa  51.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  26.95 
 
 
686 aa  51.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  34.9 
 
 
2251 aa  51.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.12 
 
 
1363 aa  51.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 
5787 aa  51.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.02 
 
 
2625 aa  50.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  35.96 
 
 
3091 aa  50.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  45.74 
 
 
833 aa  50.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  32.98 
 
 
742 aa  50.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  29.84 
 
 
2784 aa  50.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.43 
 
 
4106 aa  50.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  41.84 
 
 
3209 aa  50.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  45.78 
 
 
813 aa  50.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  34.81 
 
 
7284 aa  49.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  38.71 
 
 
2667 aa  48.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  29.63 
 
 
2198 aa  48.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.31 
 
 
1164 aa  48.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 
411 aa  48.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.34 
 
 
1963 aa  48.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  28.57 
 
 
2456 aa  48.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.21 
 
 
820 aa  48.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  38.1 
 
 
2178 aa  48.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 
385 aa  48.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  48.78 
 
 
3619 aa  48.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  28.28 
 
 
518 aa  47.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.66 
 
 
1499 aa  47.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.35 
 
 
833 aa  47.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  36.22 
 
 
942 aa  47.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  47.56 
 
 
3619 aa  47.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  40.68 
 
 
928 aa  47.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  41.05 
 
 
2105 aa  47.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  34.46 
 
 
2885 aa  47.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.78 
 
 
1279 aa  47.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.11 
 
 
421 aa  47  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  44.33 
 
 
606 aa  47.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>