22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0015 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  100 
 
 
1073 aa  2096    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  32.84 
 
 
981 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  30.78 
 
 
1787 aa  189  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2158  hypothetical protein  61.02 
 
 
1808 aa  177  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  54.4 
 
 
5080 aa  171  8e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  46.19 
 
 
1586 aa  124  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  42.59 
 
 
657 aa  118  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  28.3 
 
 
1538 aa  65.1  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.93 
 
 
1806 aa  59.7  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  32.26 
 
 
1350 aa  58.9  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0010  hypothetical protein  44.21 
 
 
178 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0567  hypothetical protein  31.16 
 
 
627 aa  54.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  35.14 
 
 
4678 aa  53.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0568  hypothetical protein  28.57 
 
 
1766 aa  52.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  33.72 
 
 
1166 aa  52.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 
5171 aa  51.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  44.3 
 
 
4854 aa  50.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.21 
 
 
3396 aa  50.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  42.42 
 
 
1594 aa  49.3  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3560  protein of unknown function DUF312  56.25 
 
 
258 aa  45.8  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20961  hemolysin-type calcium-binding domain-containing protein  33.1 
 
 
2082 aa  45.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  25.84 
 
 
1424 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>