More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0594 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 686 aa  1356    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 3184 aa  177  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.78 
 
 		 4836 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.96 
 
 		 5787 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  29.24 
 
 		 7919 aa  133  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  42.46 
 
 		 5218 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  29.82 
 
 		 4285 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  30.28 
 
 		 7149 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.43 
 
 		 5962 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  34.78 
 
 		 8682 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  34.78 
 
 		 9030 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.55 
 
 		 2239 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.02 
 
 		 6683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  34.02 
 
 		 6662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  28.4 
 
 		 5444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  37.17 
 
 		 6779 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  37.02 
 
 		 6753 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  38.59 
 
 		 4678 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  36.79 
 
 		 2542 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  28.86 
 
 		 3259 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.87 
 
 		 5839 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  50.93 
 
 		 1166 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.23 
 
 		 2812 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.93 
 
 		 4122 aa  99  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  43.87 
 
 		 7679 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.83 
 
 		 4848 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  44.14 
 
 		 4854 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  43.75 
 
 		 542 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  57.14 
 
 		 3314 aa  92.8  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  43.71 
 
 		 1699 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  39.02 
 
 		 4214 aa  89.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 		 2704 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  37.91 
 
 		 5442 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.14 
 
 		 4220 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1424 aa  84  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  46.22 
 
 		 1883 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  40.13 
 
 		 2768 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.86 
 
 		 4106 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  33.18 
 
 		 16322 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  47.97 
 
 		 8321 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.04 
 
 		 3209 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  36.71 
 
 		 1598 aa  75.5  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  37.86 
 
 		 2251 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  38.17 
 
 		 1706 aa  74.3  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  41.18 
 
 		 1156 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  39.52 
 
 		 1350 aa  72  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.45 
 
 		 1795 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  38.76 
 
 		 2452 aa  71.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  40.67 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  51.19 
 
 		 1499 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.62 
 
 		 485 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  32.44 
 
 		 219 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.82 
 
 		 9867 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  40.29 
 
 		 1806 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  38.67 
 
 		 219 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 2524 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.24 
 
 		 3427 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  46.24 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  47.5 
 
 		 2097 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  38 
 
 		 946 aa  68.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  46.07 
 
 		 3091 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  36.13 
 
 		 999 aa  67.8  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  46.43 
 
 		 1502 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  63.16 
 
 		 2667 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  48.89 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  59.62 
 
 		 2296 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.52 
 
 		 1019 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 2198 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  38.93 
 
 		 2911 aa  67  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  39.16 
 
 		 2537 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 518 aa  67  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.17 
 
 		 2105 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.39 
 
 		 2885 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.7 
 
 		 1236 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  41.18 
 
 		 2133 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40 
 
 		 1403 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.98 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  34.07 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  36.96 
 
 		 3608 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  47.78 
 
 		 781 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  35.83 
 
 		 1035 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 4334 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  36.02 
 
 		 1480 aa  65.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  45.68 
 
 		 1394 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.81 
 
 		 1279 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  41.35 
 
 		 1610 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  39.47 
 
 		 2890 aa  65.1  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  35.39 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.61 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  43.75 
 
 		 2743 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  63.27 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  50.72 
 
 		 2954 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  31.89 
 
 		 768 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34 
 
 		 2678 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  57.14 
 
 		 4798 aa  64.7  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  35.54 
 
 		 1055 aa  64.3  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  68.09 
 
 		 1582 aa  64.3  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  41.23 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  42.22 
 
 		 4791 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  45.35 
 
 		 1610 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>