More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0314 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  48.05 
 
 		 3259 aa  760    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 1553 aa  3026    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  52.34 
 
 		 3229 aa  1023    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.97 
 
 		 2067 aa  955    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  41.9 
 
 		 3182 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.66 
 
 		 1599 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  42.74 
 
 		 4285 aa  439  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  37.94 
 
 		 4661 aa  426  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  38.27 
 
 		 16311 aa  383  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.95 
 
 		 1883 aa  285  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  37.54 
 
 		 6678 aa  269  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  34.83 
 
 		 2567 aa  260  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  32.29 
 
 		 2784 aa  256  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.14 
 
 		 2239 aa  242  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  30.96 
 
 		 2887 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.59 
 
 		 8871 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  31.75 
 
 		 4854 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  32.39 
 
 		 5020 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  37.15 
 
 		 2127 aa  214  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  29.72 
 
 		 2743 aa  199  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.91 
 
 		 2812 aa  184  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  31.23 
 
 		 1206 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  29.36 
 
 		 3132 aa  166  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  32.12 
 
 		 5094 aa  160  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  29.08 
 
 		 2524 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  29.2 
 
 		 3714 aa  152  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  30.86 
 
 		 2461 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 		 3439 aa  149  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.51 
 
 		 5098 aa  146  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.04 
 
 		 3508 aa  145  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.99 
 
 		 14916 aa  144  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.71 
 
 		 4836 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  26.04 
 
 		 3091 aa  133  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  28.25 
 
 		 3758 aa  129  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.31 
 
 		 5839 aa  125  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  44.89 
 
 		 4214 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  37.78 
 
 		 5442 aa  119  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.87 
 
 		 3038 aa  118  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  33.51 
 
 		 7284 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  43.24 
 
 		 6662 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.24 
 
 		 6683 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.95 
 
 		 5787 aa  115  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  42.7 
 
 		 6779 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.24 
 
 		 4220 aa  112  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  36.09 
 
 		 2768 aa  111  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  27.06 
 
 		 1141 aa  107  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  42.39 
 
 		 4791 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  32.77 
 
 		 3026 aa  103  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.7 
 
 		 1963 aa  101  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.49 
 
 		 2555 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  40.44 
 
 		 8321 aa  99  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.74 
 
 		 4122 aa  97.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.52 
 
 		 1884 aa  97.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 2704 aa  97.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.23 
 
 		 2507 aa  94.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  33.96 
 
 		 2060 aa  94.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.64 
 
 		 2678 aa  94  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.58 
 
 		 2812 aa  93.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.67 
 
 		 4106 aa  92.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  34.43 
 
 		 2452 aa  91.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  39.88 
 
 		 219 aa  88.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  40.67 
 
 		 6753 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  41.5 
 
 		 5444 aa  87  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.79 
 
 		 9030 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  37.79 
 
 		 8682 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  42.86 
 
 		 5218 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.19 
 
 		 1372 aa  87  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1699 aa  86.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  39.08 
 
 		 16322 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.16 
 
 		 5171 aa  85.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.17 
 
 		 3699 aa  84  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  51.49 
 
 		 2885 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  38.25 
 
 		 1166 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1350 aa  84  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.5 
 
 		 1236 aa  83.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  48.91 
 
 		 2667 aa  82.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  49.45 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1806 aa  81.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.79 
 
 		 1424 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  42.31 
 
 		 709 aa  81.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.62 
 
 		 260 aa  80.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 		 5962 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  36.26 
 
 		 2251 aa  81.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  39.89 
 
 		 7149 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  38.58 
 
 		 652 aa  81.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  32 
 
 		 2336 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  47.31 
 
 		 2105 aa  80.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  47.19 
 
 		 959 aa  79  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  30.08 
 
 		 1728 aa  79  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  57.32 
 
 		 950 aa  78.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.31 
 
 		 1795 aa  78.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  49.43 
 
 		 639 aa  78.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  39.66 
 
 		 475 aa  78.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 		 475 aa  78.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  34.76 
 
 		 485 aa  78.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  46.74 
 
 		 572 aa  78.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 		 507 aa  77.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  38.3 
 
 		 1421 aa  77  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  41.23 
 
 		 561 aa  77.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.07 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>