More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0477 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 525 aa  1049    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  39.09 
 
 		 831 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  39.93 
 
 		 930 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  38.41 
 
 		 676 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  38.35 
 
 		 668 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  40.09 
 
 		 709 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.93 
 
 		 579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  36.39 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  38.06 
 
 		 627 aa  170  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.37 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  41.47 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  32.76 
 
 		 1293 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  37.38 
 
 		 390 aa  161  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.77 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  42.61 
 
 		 930 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  37.28 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.1 
 
 		 752 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.01 
 
 		 391 aa  140  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30.64 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  32.14 
 
 		 786 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.52 
 
 		 307 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1146 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  29.07 
 
 		 1079 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 		 319 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 		 1163 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.43 
 
 		 368 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  33.18 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1230 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  29.95 
 
 		 355 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 678 aa  97.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28.77 
 
 		 700 aa  96.7  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  35.8 
 
 		 1030 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 		 646 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 850 aa  93.6  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  26.03 
 
 		 1140 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.14 
 
 		 2296 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  29.95 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 		 347 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 354 aa  90.5  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  33.71 
 
 		 396 aa  90.5  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.96 
 
 		 365 aa  90.1  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  32.26 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.94 
 
 		 395 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.13 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  31.4 
 
 		 963 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1068 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  30.68 
 
 		 379 aa  86.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.91 
 
 		 359 aa  86.7  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  32.62 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1051 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.44 
 
 		 3427 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  40.16 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.56 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1351 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  32.53 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.12 
 
 		 868 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1177 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.26 
 
 		 2346 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  30.26 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 		 284 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.45 
 
 		 1553 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.18 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  33.71 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.37 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.7 
 
 		 898 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.44 
 
 		 980 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.46 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1030 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  46.36 
 
 		 3954 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  48.35 
 
 		 219 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.62 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45 
 
 		 1424 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  48.31 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  45.36 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  46.99 
 
 		 1594 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.48 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  28.52 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  48.45 
 
 		 4723 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  51.76 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.51 
 
 		 1292 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  42.98 
 
 		 686 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.38 
 
 		 1130 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.41 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.62 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.79 
 
 		 4798 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.15 
 
 		 1026 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  45 
 
 		 1814 aa  77.4  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.14 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  49.41 
 
 		 982 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.72 
 
 		 1164 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  44.68 
 
 		 5171 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  43.56 
 
 		 1538 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1750 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  47.31 
 
 		 232 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.76 
 
 		 4687 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  51.81 
 
 		 950 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>