173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1359 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 439 aa  874    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  62.96 
 
 		 646 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  50.67 
 
 		 1051 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  49.84 
 
 		 2296 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  46.97 
 
 		 963 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  39.94 
 
 		 1030 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.21 
 
 		 1130 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.24 
 
 		 1292 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  43.94 
 
 		 1026 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  37.39 
 
 		 1351 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  37.61 
 
 		 1763 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.24 
 
 		 1750 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.68 
 
 		 693 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  36.39 
 
 		 831 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 892 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 850 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 		 772 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  42.35 
 
 		 652 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 627 aa  153  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.36 
 
 		 930 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.22 
 
 		 676 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  35.76 
 
 		 709 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.23 
 
 		 668 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.99 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  33.74 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  34.44 
 
 		 579 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 		 863 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.32 
 
 		 391 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  33.55 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 491 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  34.71 
 
 		 2831 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.17 
 
 		 1079 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 		 732 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  31.79 
 
 		 588 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  36.81 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  31.11 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  36.55 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.78 
 
 		 930 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  32.68 
 
 		 623 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.27 
 
 		 752 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  34.13 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  28.18 
 
 		 448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.68 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.54 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  33.22 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.17 
 
 		 1293 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.22 
 
 		 841 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 807 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  31.75 
 
 		 503 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  30.49 
 
 		 1046 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 770 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 2961 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  30.5 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 719 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1146 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.45 
 
 		 639 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1030 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.61 
 
 		 307 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  35 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  29.77 
 
 		 805 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  31.99 
 
 		 674 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  32.16 
 
 		 1163 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 		 641 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  30.06 
 
 		 672 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.44 
 
 		 634 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 		 628 aa  90.1  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  37.63 
 
 		 1140 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  22.56 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  28.78 
 
 		 581 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.82 
 
 		 612 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  24.76 
 
 		 786 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 756 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  28.96 
 
 		 1675 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  31.46 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  26.56 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.58 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.25 
 
 		 612 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  24.79 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  28.53 
 
 		 1916 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  27.25 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  28.87 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.8 
 
 		 699 aa  80.1  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  26.69 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.54 
 
 		 2350 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.31 
 
 		 612 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  28.4 
 
 		 644 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  29.04 
 
 		 697 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  25.83 
 
 		 321 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  26.25 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.89 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  26.12 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  30.86 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.41 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  24.09 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.11 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.14 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  23.6 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>