161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1869 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 353 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  59.04 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  54.87 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  36.18 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  36.21 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  39.42 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  36.09 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  36.59 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  34.68 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  35.76 
 
 		 368 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  34.15 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.2 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  34.7 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  35.74 
 
 		 676 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  36.7 
 
 		 579 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  33.01 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  35.77 
 
 		 831 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  35.98 
 
 		 930 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  33.12 
 
 		 412 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  32.83 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  38.7 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  30.86 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  30.95 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  31.51 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  32.93 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  34.07 
 
 		 627 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.72 
 
 		 752 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  34.18 
 
 		 668 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  31.68 
 
 		 436 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 709 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  32.7 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  35.38 
 
 		 588 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.25 
 
 		 522 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  33.58 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.82 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  35.07 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  34.1 
 
 		 1293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  32.52 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.72 
 
 		 930 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.95 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.73 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  31.71 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.63 
 
 		 786 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.03 
 
 		 1146 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.18 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.53 
 
 		 1163 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1030 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  31.22 
 
 		 1140 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.6 
 
 		 898 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 888 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  34.88 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  27.86 
 
 		 899 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.96 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1030 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1750 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.49 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  31.95 
 
 		 963 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.45 
 
 		 700 aa  82.8  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1177 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  27.24 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.99 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  27.52 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  27.08 
 
 		 937 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  24.05 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1026 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  30.81 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  27.88 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  29.82 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.89 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  27.14 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  25.1 
 
 		 906 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 		 903 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1351 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.38 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.97 
 
 		 1130 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  27.34 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 683 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  26.97 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  26.97 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1834 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.06 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.79 
 
 		 1079 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.43 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.11 
 
 		 913 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  28.74 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  26.23 
 
 		 2296 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  27.6 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  22.98 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  25.32 
 
 		 732 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1230 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  29.92 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.05 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1068 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.51 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.82 
 
 		 1292 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.79 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  24.19 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>