203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0355 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 1030 aa  2079    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  34.55 
 
 		 668 aa  255  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.3 
 
 		 831 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.36 
 
 		 676 aa  225  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.82 
 
 		 930 aa  224  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  31.6 
 
 		 1293 aa  189  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  28.91 
 
 		 588 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1750 aa  158  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  34.68 
 
 		 491 aa  155  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  36.84 
 
 		 346 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  34.88 
 
 		 579 aa  144  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.8 
 
 		 752 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.63 
 
 		 1292 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  33.09 
 
 		 391 aa  128  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.76 
 
 		 963 aa  128  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  32.75 
 
 		 627 aa  127  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  31.21 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  32.01 
 
 		 390 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 522 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.34 
 
 		 1079 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.95 
 
 		 709 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.67 
 
 		 343 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29.78 
 
 		 354 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1030 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  47.06 
 
 		 930 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1026 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  33.79 
 
 		 343 aa  106  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.03 
 
 		 319 aa  105  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 850 aa  105  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  30.43 
 
 		 363 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.22 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  27.1 
 
 		 392 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.42 
 
 		 365 aa  101  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.63 
 
 		 418 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1146 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 		 652 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.46 
 
 		 361 aa  101  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.54 
 
 		 892 aa  101  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.87 
 
 		 368 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.96 
 
 		 903 aa  99  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.11 
 
 		 439 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  30.67 
 
 		 372 aa  98.6  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  30.97 
 
 		 353 aa  98.6  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  30.46 
 
 		 646 aa  98.2  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  31.17 
 
 		 373 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.12 
 
 		 343 aa  97.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  35.8 
 
 		 525 aa  96.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.24 
 
 		 1130 aa  97.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.91 
 
 		 1140 aa  95.9  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  25.13 
 
 		 2296 aa  95.1  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1834 aa  94  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 355 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  32.46 
 
 		 359 aa  94.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.59 
 
 		 693 aa  94  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.84 
 
 		 307 aa  94  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1163 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1051 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.2 
 
 		 732 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.72 
 
 		 355 aa  92  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  25.35 
 
 		 360 aa  91.3  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 770 aa  89  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.91 
 
 		 347 aa  88.2  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  26.54 
 
 		 863 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  30.8 
 
 		 1177 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 		 772 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 719 aa  85.1  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1230 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  32.99 
 
 		 323 aa  84.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.27 
 
 		 384 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  31.02 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  31.64 
 
 		 328 aa  82.8  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1351 aa  82.4  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  31.36 
 
 		 700 aa  79.7  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.19 
 
 		 899 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.22 
 
 		 898 aa  79  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  27.5 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  34.73 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  32.19 
 
 		 711 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  26.43 
 
 		 412 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  29.44 
 
 		 395 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.56 
 
 		 664 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.43 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  28.95 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  27.49 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  27.7 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  32.58 
 
 		 937 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.79 
 
 		 1763 aa  74.7  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  24.5 
 
 		 322 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  30.13 
 
 		 284 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  33.58 
 
 		 747 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  26.21 
 
 		 379 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1068 aa  71.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  24.69 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.53 
 
 		 913 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.18 
 
 		 639 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  37.86 
 
 		 211 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  22.71 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  24.5 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>