124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0617 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 361 aa  735    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  57.66 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  45.69 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.68 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  31.63 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  35.49 
 
 		 355 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.38 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.76 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.46 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  31.35 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.58 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.97 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  29.34 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.99 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  35.71 
 
 		 668 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  30.15 
 
 		 676 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  27.03 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.91 
 
 		 930 aa  123  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.18 
 
 		 396 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.96 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  31.44 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.02 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.54 
 
 		 579 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  24.13 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.89 
 
 		 418 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.94 
 
 		 491 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.57 
 
 		 831 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.57 
 
 		 588 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.46 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  30.84 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.14 
 
 		 627 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1030 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.23 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30 
 
 		 752 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.48 
 
 		 709 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.98 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.01 
 
 		 522 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1146 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1163 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.52 
 
 		 898 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.19 
 
 		 1293 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.76 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.65 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  28.75 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  26.79 
 
 		 1140 aa  79.7  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.48 
 
 		 525 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  29.08 
 
 		 903 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.97 
 
 		 930 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  32.67 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.78 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  25.36 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  26.07 
 
 		 888 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.1 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.34 
 
 		 899 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  25.85 
 
 		 786 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1068 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  28.14 
 
 		 937 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.36 
 
 		 1079 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  27.75 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  25.94 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 850 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  26.7 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 683 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.17 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1177 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.45 
 
 		 1351 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  25.7 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  30.56 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  27.05 
 
 		 684 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  24.33 
 
 		 2296 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.04 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.42 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  26.12 
 
 		 906 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  24.53 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  31.71 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.5 
 
 		 1292 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.64 
 
 		 693 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  23.23 
 
 		 913 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.97 
 
 		 1130 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  25.14 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  23.98 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  35.11 
 
 		 521 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1051 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.23 
 
 		 1750 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  27.2 
 
 		 930 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3272  NHL repeat containing protein  30.38 
 
 		 1095 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333117  normal  0.0421668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.1 
 
 		 646 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  25.42 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1763 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  33.72 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  26.21 
 
 		 668 aa  50.8  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  24.72 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.07 
 
 		 963 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.03 
 
 		 439 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  29.59 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  25.13 
 
 		 621 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  21.28 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>