150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0258 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 343 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  44.38 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  42.99 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  40.52 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  40.26 
 
 		 355 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  39.16 
 
 		 354 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  34.03 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  34.02 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  39.42 
 
 		 353 aa  185  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  35.07 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  33.89 
 
 		 359 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.01 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.74 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  32.7 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  35.92 
 
 		 831 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36 
 
 		 930 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  37.89 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  34.32 
 
 		 491 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  31 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.21 
 
 		 676 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  36 
 
 		 668 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  35.69 
 
 		 579 aa  135  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  29.77 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.79 
 
 		 752 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  34.35 
 
 		 522 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  29.63 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.68 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  35.68 
 
 		 627 aa  123  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.42 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  29.27 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  28.83 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  31.99 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  33.45 
 
 		 1293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.13 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.62 
 
 		 709 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.15 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  32.2 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1163 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1146 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  33.79 
 
 		 1030 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.94 
 
 		 588 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.17 
 
 		 930 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.48 
 
 		 1140 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  35.67 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.45 
 
 		 786 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.26 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  32.5 
 
 		 903 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.27 
 
 		 639 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  31.82 
 
 		 888 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  29.79 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.56 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1068 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.66 
 
 		 1079 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  26.59 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.58 
 
 		 898 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 		 683 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1177 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1351 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1230 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.62 
 
 		 1292 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.55 
 
 		 899 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  36.07 
 
 		 684 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  26.24 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  27.99 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 850 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  25.82 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  31.93 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1030 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.01 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  31 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  31.52 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  25.54 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.61 
 
 		 693 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1750 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  27.85 
 
 		 937 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  23.6 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.76 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  21.13 
 
 		 1834 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  31.65 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  28.14 
 
 		 906 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  29.12 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  27.75 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  25.78 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 		 732 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1026 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  30.77 
 
 		 913 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  35.97 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.3 
 
 		 664 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  26.83 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  28.48 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.12 
 
 		 2296 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.95 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.29 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  27.87 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1051 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  27.91 
 
 		 963 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.15 
 
 		 841 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 		 686 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>