73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2505 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 315 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  36.13 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  39.47 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3163  NHL repeat domain protein  38.06 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3065  NHL repeat-containing protein  38.52 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3258  NHL repeat domain protein  35.46 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  44.94 
 
 		 1140 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  34.4 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.54 
 
 		 930 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.63 
 
 		 831 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.23 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.81 
 
 		 930 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.85 
 
 		 668 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.2 
 
 		 752 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.48 
 
 		 579 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.52 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.48 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  26.87 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.88 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  24.68 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 676 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  29.6 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.48 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  28.48 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  25.45 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  36.17 
 
 		 1146 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.56 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  37.23 
 
 		 1163 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  31.45 
 
 		 522 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  31.31 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 		 627 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  21.86 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.66 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  31.63 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.74 
 
 		 1293 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  32.95 
 
 		 709 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  23.58 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.68 
 
 		 491 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  31.25 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.91 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  29.89 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  24.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.32 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  29.66 
 
 		 436 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  39.19 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.2 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  32.94 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  28.48 
 
 		 684 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1068 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 683 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.78 
 
 		 786 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.5 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1030 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  23.96 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.93 
 
 		 899 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  27.18 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.05 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1230 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  25.37 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.68 
 
 		 898 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.58 
 
 		 525 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35 
 
 		 1130 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  26.67 
 
 		 386 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  29.57 
 
 		 521 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.81 
 
 		 322 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.42 
 
 		 639 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>