256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1273 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 387 aa  763    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  58.1 
 
 		 668 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  53.47 
 
 		 676 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  57.18 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  53.4 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  60.14 
 
 		 930 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  54.69 
 
 		 831 aa  315  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  46.7 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  52.29 
 
 		 930 aa  285  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  48.87 
 
 		 579 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  53.69 
 
 		 346 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  48.44 
 
 		 627 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  49.68 
 
 		 522 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  47.46 
 
 		 709 aa  249  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  43.37 
 
 		 752 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  44.44 
 
 		 1293 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  40.71 
 
 		 588 aa  219  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  42.16 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  39.02 
 
 		 392 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.72 
 
 		 786 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  38.07 
 
 		 963 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.77 
 
 		 525 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.05 
 
 		 1140 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  34.56 
 
 		 646 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.28 
 
 		 1163 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1146 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1068 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  38.41 
 
 		 1079 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1051 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.03 
 
 		 2296 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  33.99 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.94 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1030 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  33.53 
 
 		 1351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.63 
 
 		 1750 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 850 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.22 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.7 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1026 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  75 
 
 		 735 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  39.82 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  72.37 
 
 		 627 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  85.71 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  60.38 
 
 		 958 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1030 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  66.27 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  68.49 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  34.28 
 
 		 664 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.23 
 
 		 1292 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1763 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.81 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  28.89 
 
 		 739 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  64.47 
 
 		 848 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.82 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29.32 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  30.15 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  68.57 
 
 		 749 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  64.56 
 
 		 787 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.12 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  51.64 
 
 		 479 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.35 
 
 		 1130 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  69.57 
 
 		 110 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  64.38 
 
 		 869 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.41 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  62.96 
 
 		 919 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  32.16 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  30.48 
 
 		 652 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  67.14 
 
 		 294 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  65.75 
 
 		 1056 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  74.6 
 
 		 561 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  28.38 
 
 		 1046 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  31.28 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  33.08 
 
 		 841 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  32.12 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 892 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1177 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  29.47 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  65.71 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.89 
 
 		 903 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  26.62 
 
 		 347 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1834 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  57.5 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.77 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.64 
 
 		 693 aa  99.4  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.64 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.58 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  60.81 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  64.29 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  26.64 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.26 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  26.86 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  36.18 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  25.45 
 
 		 700 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  25.87 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  28.83 
 
 		 448 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>