29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3258 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3258  NHL repeat domain protein  100 
 
 		 313 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3163  NHL repeat domain protein  90.1 
 
 		 313 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3065  NHL repeat-containing protein  84.52 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  41.01 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  38.54 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  35.46 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  31.91 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.35 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  31.74 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  24.62 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.39 
 
 		 930 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.27 
 
 		 1293 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  29.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  23.2 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  33.73 
 
 		 379 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.22 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.1 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.37 
 
 		 831 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  25.87 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.68 
 
 		 676 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1146 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.43 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.27 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  21.01 
 
 		 752 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.16 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  46.15 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  24.6 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.07 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>