129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2282 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 373 aa  741    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  34.49 
 
 		 668 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.97 
 
 		 676 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  33.59 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.78 
 
 		 831 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  34.42 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  33.84 
 
 		 930 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.81 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.09 
 
 		 579 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.56 
 
 		 752 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.68 
 
 		 522 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.75 
 
 		 627 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  28.12 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.38 
 
 		 709 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.7 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1030 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.8 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.87 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  39.58 
 
 		 700 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.08 
 
 		 1163 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.31 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  28.28 
 
 		 588 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30.68 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  34.57 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  29.64 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.96 
 
 		 1293 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32.8 
 
 		 1140 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.03 
 
 		 1146 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  29.96 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  29.67 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 525 aa  86.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  33.16 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  30.09 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.38 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  32.38 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  33.75 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.68 
 
 		 930 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  32.9 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.08 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  32.47 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  35.81 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.64 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  31.45 
 
 		 888 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  26.59 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.98 
 
 		 903 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 		 898 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1030 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.81 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.87 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.32 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.15 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  34.81 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  27.35 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  32.04 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1230 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1177 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.61 
 
 		 899 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  36.97 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.71 
 
 		 1079 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  32.3 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.04 
 
 		 639 aa  66.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1750 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  30.27 
 
 		 906 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  27.67 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  34.51 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  30.77 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.61 
 
 		 786 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1558  NHL repeat containing protein  36.84 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  22.26 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1351 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1068 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  30.92 
 
 		 913 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.17 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2281  hypothetical protein  35.59 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  26.7 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  37.62 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  25.98 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.85 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  23.66 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1051 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.72 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  29.8 
 
 		 937 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  31.91 
 
 		 684 aa  56.6  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 		 850 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.32 
 
 		 2296 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.81 
 
 		 693 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  31.5 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  26.32 
 
 		 1046 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.59 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  29.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 863 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 1026 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.09 
 
 		 1130 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  26.75 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  24.27 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  24.88 
 
 		 963 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.37 
 
 		 711 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>