172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1167 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1203    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  43.59 
 
 
831 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.45 
 
 
930 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  41.51 
 
 
676 aa  444  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  40.41 
 
 
668 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  35.2 
 
 
1293 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  40.91 
 
 
346 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  39.93 
 
 
627 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  41.79 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  40.71 
 
 
387 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.03 
 
 
1026 aa  216  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  39.39 
 
 
930 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  37.04 
 
 
752 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  39.93 
 
 
709 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  42.25 
 
 
392 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  38.64 
 
 
522 aa  203  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.35 
 
 
343 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  38.83 
 
 
390 aa  187  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.91 
 
 
1030 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  35.36 
 
 
491 aa  177  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.78 
 
 
1068 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 
963 aa  167  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.67 
 
 
1130 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  34.56 
 
 
391 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  37.28 
 
 
525 aa  155  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.04 
 
 
1292 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.67 
 
 
1750 aa  143  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.62 
 
 
786 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.23 
 
 
1146 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 
319 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.8 
 
 
1163 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.78 
 
 
1140 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.23 
 
 
1079 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.68 
 
 
307 aa  123  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.38 
 
 
353 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
1230 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  31.79 
 
 
439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.31 
 
 
2296 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  31.49 
 
 
1051 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.57 
 
 
1351 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  39.16 
 
 
347 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.79 
 
 
365 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.14 
 
 
354 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  26.32 
 
 
322 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.15 
 
 
646 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  31.3 
 
 
355 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  30.28 
 
 
363 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  35.19 
 
 
418 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 
343 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.45 
 
 
361 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.6 
 
 
355 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  25.7 
 
 
318 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  29.72 
 
 
343 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  26.05 
 
 
321 aa  104  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  27.95 
 
 
1030 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 
360 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.66 
 
 
372 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  28 
 
 
1177 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
892 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.8 
 
 
368 aa  97.1  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  23.86 
 
 
323 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
850 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  26.88 
 
 
328 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.06 
 
 
359 aa  95.5  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25.29 
 
 
903 aa  94.7  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.51 
 
 
899 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.8 
 
 
412 aa  94  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.78 
 
 
898 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.09 
 
 
326 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  25.83 
 
 
315 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.96 
 
 
379 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  22.91 
 
 
364 aa  90.9  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 
284 aa  90.5  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  27.21 
 
 
396 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.57 
 
 
384 aa  88.2  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  28.36 
 
 
373 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  28.9 
 
 
888 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  24.95 
 
 
652 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 
279 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.66 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.74 
 
 
693 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  24.08 
 
 
1763 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  27.06 
 
 
436 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  22.09 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  25.47 
 
 
303 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  29.54 
 
 
379 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  29.26 
 
 
700 aa  81.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 
678 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.18 
 
 
1834 aa  79.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  22.87 
 
 
772 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  26.28 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25.49 
 
 
639 aa  77.8  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  29.44 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  24.43 
 
 
359 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  27.9 
 
 
405 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  27.36 
 
 
747 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
683 aa  76.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  24.66 
 
 
841 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  28.52 
 
 
660 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>