144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2755 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
347 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  57.23 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  52.48 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  50 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  45.9 
 
 
343 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  36.81 
 
 
343 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  35.09 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  34.88 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  37.01 
 
 
353 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  35.91 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  35.61 
 
 
363 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.88 
 
 
360 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  32.59 
 
 
359 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 
418 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.62 
 
 
384 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.57 
 
 
831 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 
368 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.61 
 
 
396 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.41 
 
 
676 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.1 
 
 
668 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  30.31 
 
 
395 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  33.93 
 
 
346 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.27 
 
 
930 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.07 
 
 
319 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.08 
 
 
579 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  27.64 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  39.16 
 
 
588 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.57 
 
 
491 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.26 
 
 
709 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.36 
 
 
522 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  26.93 
 
 
436 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.82 
 
 
343 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  36.02 
 
 
1140 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.84 
 
 
627 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  37.97 
 
 
1293 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.05 
 
 
391 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.2 
 
 
1146 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.2 
 
 
1163 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.62 
 
 
387 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.27 
 
 
752 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  32.43 
 
 
390 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  38.24 
 
 
930 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  32.08 
 
 
392 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 
525 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.65 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.91 
 
 
1030 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  27 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  30.17 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.43 
 
 
786 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.34 
 
 
1079 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  32.84 
 
 
903 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.94 
 
 
888 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.94 
 
 
1292 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.27 
 
 
693 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.87 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 
1026 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.68 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 
899 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  25.35 
 
 
1177 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 
963 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30.81 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  23.28 
 
 
1068 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  30.45 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.02 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  31.09 
 
 
700 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  30.97 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
683 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.49 
 
 
1351 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 
898 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  28.28 
 
 
747 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 
906 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.88 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.66 
 
 
2296 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
1230 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  31.2 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  21.1 
 
 
1750 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  35.26 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  29.38 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.41 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  30.89 
 
 
937 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  33.05 
 
 
211 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  31.54 
 
 
328 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  27.43 
 
 
913 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  33.09 
 
 
930 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  36.17 
 
 
678 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.09 
 
 
1130 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  34.78 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 
303 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
719 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  29.73 
 
 
405 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  29.31 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  25.57 
 
 
652 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  21.23 
 
 
1030 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 
850 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.1 
 
 
1051 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.1 
 
 
447 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>