98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1109 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
521 aa  1073    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  30.32 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.34 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  40 
 
 
395 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  40.7 
 
 
522 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  33.09 
 
 
1146 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  33.98 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  35.29 
 
 
588 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  40 
 
 
930 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  41.84 
 
 
831 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.22 
 
 
1163 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  41.98 
 
 
709 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.59 
 
 
930 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.65 
 
 
343 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  32.23 
 
 
396 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  26.76 
 
 
368 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  41.25 
 
 
668 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  38.27 
 
 
676 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  37.5 
 
 
700 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  40.26 
 
 
627 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  26.4 
 
 
684 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.23 
 
 
1140 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  45.07 
 
 
752 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  39.73 
 
 
1293 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  35.8 
 
 
387 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  35.45 
 
 
319 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  38.16 
 
 
491 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.4 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  30.82 
 
 
449 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  37.62 
 
 
373 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  42.11 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
678 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.83 
 
 
1068 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.67 
 
 
379 aa  57  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
683 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1539  NHL repeat containing protein  35.37 
 
 
267 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  37.21 
 
 
391 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  37.04 
 
 
392 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  35.8 
 
 
355 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  40.79 
 
 
412 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  28.69 
 
 
365 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  33.05 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.78 
 
 
525 aa  54.3  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  35.11 
 
 
361 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  27.89 
 
 
349 aa  54.3  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  32.5 
 
 
343 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.78 
 
 
418 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 
899 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  34.25 
 
 
404 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  37.65 
 
 
318 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  26.67 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  23.9 
 
 
390 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  26.24 
 
 
360 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  32.47 
 
 
405 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  28.47 
 
 
357 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.69 
 
 
639 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  40.54 
 
 
322 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  31.03 
 
 
453 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  28.67 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  35.11 
 
 
913 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 
347 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  37.37 
 
 
1030 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.97 
 
 
1292 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  30.77 
 
 
930 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  32.14 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
1230 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  28.26 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.95 
 
 
307 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  31.67 
 
 
450 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  36.84 
 
 
284 aa  48.9  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  24.38 
 
 
371 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.03 
 
 
898 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  31.71 
 
 
353 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.53 
 
 
2296 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  27.56 
 
 
369 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  23.68 
 
 
355 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
850 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  32.61 
 
 
716 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 
786 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  22.42 
 
 
456 aa  47  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.38 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.71 
 
 
693 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  30.47 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  26.67 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.58 
 
 
903 aa  45.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  30 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  26.92 
 
 
323 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  30.91 
 
 
211 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  36.49 
 
 
321 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  26 
 
 
660 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 
439 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.36 
 
 
343 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  34.48 
 
 
1177 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  26.92 
 
 
415 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  32.99 
 
 
888 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  36.36 
 
 
747 aa  43.5  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  34.25 
 
 
326 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>