174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0408 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 693 aa  1373    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  40.65 
 
 		 963 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  36.68 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  38.44 
 
 		 1051 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.49 
 
 		 1130 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.76 
 
 		 1292 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  35.56 
 
 		 646 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  38.59 
 
 		 1026 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1351 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1030 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 		 850 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.33 
 
 		 2296 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.54 
 
 		 1750 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  38.6 
 
 		 652 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 		 892 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 		 807 aa  127  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 		 719 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30.39 
 
 		 2831 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.41 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1763 aa  114  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.53 
 
 		 930 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.77 
 
 		 831 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  31.21 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  39.76 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 732 aa  107  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.51 
 
 		 668 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.76 
 
 		 491 aa  104  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  32.77 
 
 		 627 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.87 
 
 		 752 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.17 
 
 		 579 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  31.64 
 
 		 387 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  32.46 
 
 		 1163 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  37.56 
 
 		 504 aa  98.6  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 		 676 aa  97.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.15 
 
 		 1140 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  37.9 
 
 		 623 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.16 
 
 		 930 aa  95.5  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.77 
 
 		 343 aa  94.7  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  32.75 
 
 		 1146 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1030 aa  94  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  31.46 
 
 		 1046 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 		 863 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.08 
 
 		 841 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.13 
 
 		 1293 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 		 425 aa  91.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 		 770 aa  91.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  30.11 
 
 		 448 aa  90.5  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.72 
 
 		 390 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.93 
 
 		 709 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1177 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  49.44 
 
 		 453 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  28.82 
 
 		 359 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  33.94 
 
 		 487 aa  87  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  30.65 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.22 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.74 
 
 		 588 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.67 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  31.96 
 
 		 2350 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  27.03 
 
 		 503 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.31 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 		 628 aa  81.6  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  31.52 
 
 		 664 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.27 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.89 
 
 		 307 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  33.07 
 
 		 498 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  26.23 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  29.29 
 
 		 1675 aa  77  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.59 
 
 		 447 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  34.66 
 
 		 672 aa  77  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  35.63 
 
 		 2961 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.22 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  29.26 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.38 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  41.13 
 
 		 674 aa  74.7  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  36.04 
 
 		 470 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  27.53 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  27.02 
 
 		 365 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.6 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  29.15 
 
 		 1079 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.95 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.03 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  32.37 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.12 
 
 		 641 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 756 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.18 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  28.24 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  28.76 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  31.35 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.9 
 
 		 612 aa  68.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  28.06 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1230 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  26.1 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.38 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.91 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  23.32 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.52 
 
 		 612 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  22.05 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  35.04 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  28.05 
 
 		 1916 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>