245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3465 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 
447 aa  898    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  47.03 
 
 
320 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  39.86 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.88 
 
 
831 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  36.59 
 
 
676 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.96 
 
 
930 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  44.34 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.92 
 
 
930 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  41.18 
 
 
176 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 
153 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.9 
 
 
579 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  35.53 
 
 
522 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  39.67 
 
 
625 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  42.48 
 
 
652 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  40.52 
 
 
383 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.89 
 
 
709 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  41.43 
 
 
421 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.04 
 
 
343 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
627 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 
329 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  33.21 
 
 
664 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  39.67 
 
 
704 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.58 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  33.58 
 
 
390 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  36.22 
 
 
741 aa  96.3  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40.45 
 
 
752 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.37 
 
 
668 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  31.56 
 
 
786 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  36.36 
 
 
763 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  40.59 
 
 
414 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  36 
 
 
1118 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  29.77 
 
 
343 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  35.54 
 
 
754 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.18 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  39.22 
 
 
458 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.48 
 
 
1292 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  34.65 
 
 
549 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  37.25 
 
 
781 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  31.15 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 
784 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.75 
 
 
963 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.92 
 
 
1351 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  30.58 
 
 
439 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 
1026 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.3 
 
 
1051 aa  83.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  32.38 
 
 
646 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  33.49 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  33.59 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  33.85 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  34.17 
 
 
749 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  35.25 
 
 
758 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.29 
 
 
2296 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  31.36 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  33.1 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.37 
 
 
1293 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.82 
 
 
1750 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  33.6 
 
 
269 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  33.6 
 
 
269 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
746 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  31.06 
 
 
451 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  37.62 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.94 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  27.49 
 
 
1030 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  37.36 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.86 
 
 
491 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.59 
 
 
693 aa  76.6  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  28.47 
 
 
1079 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  35.25 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  33.33 
 
 
751 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.65 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  28 
 
 
732 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  30.58 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  37.23 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.06 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.68 
 
 
907 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  31.03 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  33.98 
 
 
950 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  29.41 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  33.01 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  35.92 
 
 
113 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  32.26 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  27.54 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  24.01 
 
 
1763 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  34.74 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  34 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  32.41 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  26.64 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  31 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.98 
 
 
354 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  33.98 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  34.74 
 
 
262 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.52 
 
 
841 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  27.17 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.66 
 
 
1163 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  32.4 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>