184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4723 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 1079 aa  2130    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  72.01 
 
 		 994 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1976 aa  204  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.8 
 
 		 930 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  39.43 
 
 		 390 aa  188  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  38.05 
 
 		 831 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  39.01 
 
 		 522 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  38.08 
 
 		 668 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  35.03 
 
 		 579 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  36.25 
 
 		 676 aa  161  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  37.05 
 
 		 627 aa  157  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  35.18 
 
 		 346 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.95 
 
 		 1527 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.04 
 
 		 1750 aa  147  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32 
 
 		 930 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  36.08 
 
 		 709 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 		 850 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  37.07 
 
 		 387 aa  144  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  37.72 
 
 		 646 aa  144  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.23 
 
 		 752 aa  138  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.17 
 
 		 343 aa  137  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  31.02 
 
 		 1293 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  35.78 
 
 		 1351 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  31.83 
 
 		 392 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  31.72 
 
 		 953 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.37 
 
 		 2411 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  36.36 
 
 		 391 aa  127  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.37 
 
 		 2367 aa  126  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.03 
 
 		 588 aa  124  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  38.66 
 
 		 2296 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  34.64 
 
 		 664 aa  122  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  35.17 
 
 		 439 aa  121  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1030 aa  119  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  31.35 
 
 		 491 aa  118  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  31.65 
 
 		 307 aa  115  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1051 aa  115  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  31.47 
 
 		 1030 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1969 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.05 
 
 		 525 aa  111  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.06 
 
 		 963 aa  105  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  32.47 
 
 		 343 aa  104  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 772 aa  104  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  31.33 
 
 		 786 aa  102  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  31.98 
 
 		 1763 aa  101  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  27.15 
 
 		 425 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.1 
 
 		 2807 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 892 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1146 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 		 1163 aa  95.9  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.58 
 
 		 1292 aa  95.5  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  30.71 
 
 		 2421 aa  94.7  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  30.5 
 
 		 2454 aa  94.7  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.98 
 
 		 1140 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1026 aa  92.8  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.17 
 
 		 711 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.71 
 
 		 652 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  26.04 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  31.61 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.34 
 
 		 347 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 732 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.2 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  30.4 
 
 		 1046 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.19 
 
 		 1130 aa  77  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  31.48 
 
 		 841 aa  77  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  28.47 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 770 aa  76.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25.75 
 
 		 903 aa  76.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.45 
 
 		 1507 aa  75.5  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  31.23 
 
 		 1177 aa  75.5  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.89 
 
 		 1607 aa  75.5  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 863 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  27.97 
 
 		 319 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  29.74 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 		 719 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  23.29 
 
 		 2713 aa  72.4  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  30.28 
 
 		 2345 aa  72  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  26.39 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.38 
 
 		 363 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.15 
 
 		 693 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  31.28 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.79 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  31.74 
 
 		 1288 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  27.92 
 
 		 361 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  35.71 
 
 		 373 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  29.46 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  26.78 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 2831 aa  64.7  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.39 
 
 		 14944 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.8 
 
 		 3793 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  27.48 
 
 		 380 aa  63.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  35.48 
 
 		 1170 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  29.15 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1329 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  23.86 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.1 
 
 		 1657 aa  61.6  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>