156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2779 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  100 
 
 		 1051 aa  2106    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  50.67 
 
 		 439 aa  291  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  54.15 
 
 		 646 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  50.81 
 
 		 2296 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  47.73 
 
 		 963 aa  251  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  42.66 
 
 		 1030 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  44.16 
 
 		 1026 aa  238  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  41.6 
 
 		 1351 aa  236  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.54 
 
 		 1292 aa  218  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.77 
 
 		 1130 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  43.23 
 
 		 1750 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  37.42 
 
 		 850 aa  188  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  36.14 
 
 		 1763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  38.5 
 
 		 652 aa  173  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.44 
 
 		 693 aa  172  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 		 892 aa  171  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.19 
 
 		 831 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 		 772 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  34.05 
 
 		 930 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.85 
 
 		 668 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  38.31 
 
 		 2831 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  35.42 
 
 		 623 aa  144  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  35.6 
 
 		 359 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  32.66 
 
 		 387 aa  141  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.12 
 
 		 676 aa  141  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  34.86 
 
 		 346 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  33.23 
 
 		 522 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 863 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  33.44 
 
 		 390 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.7 
 
 		 627 aa  127  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  32.13 
 
 		 709 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.44 
 
 		 579 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  34.23 
 
 		 1046 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  31.49 
 
 		 588 aa  118  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  39.82 
 
 		 460 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.74 
 
 		 841 aa  117  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  32.76 
 
 		 504 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 732 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.47 
 
 		 343 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.06 
 
 		 1079 aa  115  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 719 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.79 
 
 		 930 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  31.46 
 
 		 392 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  29.61 
 
 		 404 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  28.99 
 
 		 391 aa  112  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  33.21 
 
 		 2961 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  32.49 
 
 		 487 aa  108  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.45 
 
 		 493 aa  107  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 770 aa  107  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.07 
 
 		 752 aa  106  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  31.53 
 
 		 503 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.45 
 
 		 491 aa  104  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  29.64 
 
 		 425 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  31.62 
 
 		 448 aa  102  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  31.63 
 
 		 1675 aa  102  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  32.13 
 
 		 470 aa  100  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  28.36 
 
 		 581 aa  99  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  28.53 
 
 		 510 aa  99  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1030 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 807 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  30.07 
 
 		 672 aa  92.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.54 
 
 		 498 aa  90.1  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.45 
 
 		 1293 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  25.44 
 
 		 362 aa  90.1  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 756 aa  88.2  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  30.58 
 
 		 674 aa  87.4  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.27 
 
 		 525 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  26.37 
 
 		 805 aa  85.9  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1163 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  28.22 
 
 		 2350 aa  85.9  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.3 
 
 		 447 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.09 
 
 		 628 aa  82.8  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.17 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1146 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  31.43 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  26.62 
 
 		 634 aa  81.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  34.8 
 
 		 1140 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.97 
 
 		 786 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.85 
 
 		 612 aa  79  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.56 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.38 
 
 		 639 aa  78.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  30.3 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.76 
 
 		 612 aa  78.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  27.64 
 
 		 359 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  29.28 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  29.71 
 
 		 644 aa  73.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  28.31 
 
 		 1916 aa  72.8  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.35 
 
 		 612 aa  71.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.14 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  26.32 
 
 		 584 aa  69.7  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.77 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.49 
 
 		 322 aa  67  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.44 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  26.32 
 
 		 711 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  26.62 
 
 		 365 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  28.09 
 
 		 321 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.52 
 
 		 323 aa  64.3  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  27.12 
 
 		 697 aa  62.4  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  33.81 
 
 		 694 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  23.55 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>