More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2158 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 1750 aa  3469    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  50.55 
 
 		 1030 aa  317  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  51.04 
 
 		 1351 aa  296  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  36.12 
 
 		 963 aa  279  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.17 
 
 		 1130 aa  279  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  35.4 
 
 		 1026 aa  273  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 		 850 aa  265  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.86 
 
 		 831 aa  262  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  48.9 
 
 		 892 aa  253  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.95 
 
 		 930 aa  248  8e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.31 
 
 		 1292 aa  246  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  45.43 
 
 		 772 aa  241  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  30.97 
 
 		 676 aa  233  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  40.26 
 
 		 1763 aa  227  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.15 
 
 		 668 aa  218  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  44.08 
 
 		 1051 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  44.48 
 
 		 623 aa  210  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.63 
 
 		 2296 aa  210  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  42.36 
 
 		 646 aa  206  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  33.38 
 
 		 652 aa  202  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  45.12 
 
 		 863 aa  199  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  37.54 
 
 		 439 aa  197  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  38.04 
 
 		 2831 aa  184  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  35.36 
 
 		 425 aa  178  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.15 
 
 		 1293 aa  170  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 		 719 aa  169  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1030 aa  160  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 		 732 aa  158  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  33.5 
 
 		 2350 aa  156  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  34.9 
 
 		 770 aa  155  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  36.34 
 
 		 1107 aa  150  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 807 aa  149  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.04 
 
 		 1079 aa  148  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  39.93 
 
 		 1046 aa  148  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  34.1 
 
 		 346 aa  147  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.71 
 
 		 588 aa  146  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  35.71 
 
 		 504 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  37.34 
 
 		 756 aa  143  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.92 
 
 		 693 aa  140  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 2961 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  28.79 
 
 		 2074 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  33.88 
 
 		 579 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.48 
 
 		 709 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.68 
 
 		 1212 aa  132  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30.5 
 
 		 522 aa  132  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.16 
 
 		 850 aa  132  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  39.3 
 
 		 2153 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.63 
 
 		 387 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35.69 
 
 		 833 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.62 
 
 		 994 aa  129  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  42.71 
 
 		 1755 aa  127  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  31.25 
 
 		 627 aa  126  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  31.04 
 
 		 448 aa  120  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.08 
 
 		 2031 aa  119  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  32.44 
 
 		 1916 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  32.99 
 
 		 487 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.31 
 
 		 391 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  33.43 
 
 		 805 aa  117  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.57 
 
 		 1217 aa  117  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.63 
 
 		 2507 aa  117  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.86 
 
 		 841 aa  115  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.79 
 
 		 460 aa  115  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  115  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  31.73 
 
 		 510 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.36 
 
 		 1597 aa  112  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  40.49 
 
 		 715 aa  112  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  28.47 
 
 		 362 aa  111  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  31.23 
 
 		 581 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.3 
 
 		 390 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  33.22 
 
 		 1011 aa  110  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.5 
 
 		 752 aa  109  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.87 
 
 		 4978 aa  109  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.37 
 
 		 930 aa  109  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.64 
 
 		 761 aa  109  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  36.84 
 
 		 635 aa  107  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.19 
 
 		 852 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.76 
 
 		 5745 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.83 
 
 		 343 aa  105  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.86 
 
 		 491 aa  102  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.78 
 
 		 1771 aa  102  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  30.46 
 
 		 404 aa  101  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  37.62 
 
 		 1163 aa  101  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  33.08 
 
 		 470 aa  102  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  32.39 
 
 		 503 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 		 1146 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.66 
 
 		 493 aa  100  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.36 
 
 		 892 aa  99.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.64 
 
 		 2839 aa  99.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.62 
 
 		 786 aa  99.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  34.46 
 
 		 634 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.79 
 
 		 3474 aa  97.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  37.31 
 
 		 635 aa  97.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.99 
 
 		 359 aa  96.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  31.35 
 
 		 743 aa  95.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.52 
 
 		 664 aa  95.5  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.63 
 
 		 1269 aa  95.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.92 
 
 		 1884 aa  95.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.86 
 
 		 1140 aa  93.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  30.29 
 
 		 1092 aa  93.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.88 
 
 		 872 aa  93.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>