More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1156 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  58.8 
 
 		 2831 aa  2267    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  31.16 
 
 		 2350 aa  667    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2961 aa  6004    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  45.11 
 
 		 1763 aa  1266    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 3073 aa  323  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  29.05 
 
 		 2387 aa  254  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4064  YD repeat-containing protein  56.25 
 
 		 201 aa  188  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  43.27 
 
 		 1351 aa  166  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25 
 
 		 1599 aa  163  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1600 aa  157  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1352 aa  154  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  39.16 
 
 		 1030 aa  152  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  29.57 
 
 		 741 aa  147  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1942 aa  146  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1917 aa  145  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 		 850 aa  143  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  35.93 
 
 		 892 aa  142  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1669 aa  141  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  28.73 
 
 		 788 aa  141  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  28.73 
 
 		 788 aa  141  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1611 aa  138  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.82 
 
 		 1271 aa  135  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1840 aa  135  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 3193 aa  133  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1750 aa  133  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.59 
 
 		 2096 aa  129  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  28.14 
 
 		 764 aa  128  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.44 
 
 		 1572 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.9 
 
 		 2149 aa  128  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1959 aa  127  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.28 
 
 		 1568 aa  124  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.8 
 
 		 1576 aa  124  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.12 
 
 		 1614 aa  124  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.28 
 
 		 1595 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.44 
 
 		 1586 aa  121  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  35.52 
 
 		 772 aa  120  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.97 
 
 		 2296 aa  120  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  26.21 
 
 		 2225 aa  119  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.4 
 
 		 2277 aa  119  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  21.58 
 
 		 1560 aa  119  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.51 
 
 		 678 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  21.84 
 
 		 1639 aa  117  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  22.64 
 
 		 1673 aa  117  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3061  hypothetical protein  32.33 
 
 		 426 aa  116  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 2003 aa  116  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  28.83 
 
 		 705 aa  115  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.98 
 
 		 924 aa  115  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.13 
 
 		 1384 aa  114  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 690 aa  114  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  23.04 
 
 		 1679 aa  113  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.49 
 
 		 1485 aa  113  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.41 
 
 		 1509 aa  112  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1558 aa  112  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.26 
 
 		 1488 aa  112  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  32.95 
 
 		 963 aa  111  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1531 aa  110  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.78 
 
 		 738 aa  111  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.33 
 
 		 1530 aa  110  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 927 aa  110  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  33.21 
 
 		 1051 aa  110  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.57 
 
 		 903 aa  108  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.15 
 
 		 2246 aa  108  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1409 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1541 aa  107  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1541 aa  107  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25.46 
 
 		 2221 aa  107  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1541 aa  107  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1026 aa  106  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 		 863 aa  106  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1541 aa  105  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1541 aa  105  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1541 aa  105  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.62 
 
 		 646 aa  104  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1381 aa  104  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 439 aa  105  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.71 
 
 		 1489 aa  105  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.29 
 
 		 2731 aa  104  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.96 
 
 		 2178 aa  105  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 869 aa  103  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 3273 aa  102  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  21.35 
 
 		 1699 aa  102  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.79 
 
 		 1467 aa  102  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26 
 
 		 1577 aa  102  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 		 756 aa  102  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1400 aa  101  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25 
 
 		 2224 aa  101  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  31.7 
 
 		 451 aa  101  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  24.39 
 
 		 840 aa  101  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25 
 
 		 2224 aa  101  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1390 aa  101  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.45 
 
 		 1518 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.97 
 
 		 1385 aa  100  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  23.14 
 
 		 1401 aa  100  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.05 
 
 		 3027 aa  100  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1495 aa  100  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.89 
 
 		 1292 aa  99.8  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1386 aa  99.8  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 867 aa  99.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1197 aa  99.4  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 2294 aa  99  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>