More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3576 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  100 
 
 		 2149 aa  4373    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.13 
 
 		 2096 aa  516  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1942 aa  394  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1840 aa  387  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 		 2035 aa  386  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1669 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1959 aa  383  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.85 
 
 		 3027 aa  381  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1917 aa  380  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  29.69 
 
 		 1271 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  29.72 
 
 		 2277 aa  361  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1352 aa  360  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1600 aa  336  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.27 
 
 		 1953 aa  314  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 3689 aa  310  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.5 
 
 		 2731 aa  290  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.19 
 
 		 1560 aa  264  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.91 
 
 		 1527 aa  255  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1390 aa  250  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1551 aa  250  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1550 aa  246  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1547 aa  243  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.6 
 
 		 1467 aa  242  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  29.75 
 
 		 1485 aa  237  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.83 
 
 		 1579 aa  235  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.83 
 
 		 1428 aa  234  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.84 
 
 		 1518 aa  234  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1520 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.87 
 
 		 1485 aa  231  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  27.03 
 
 		 1434 aa  230  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.25 
 
 		 1599 aa  229  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.45 
 
 		 3273 aa  229  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.66 
 
 		 1576 aa  226  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.1 
 
 		 1381 aa  226  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.15 
 
 		 3073 aa  225  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.23 
 
 		 1586 aa  223  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1197 aa  223  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.19 
 
 		 1595 aa  222  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.67 
 
 		 1572 aa  221  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.6 
 
 		 1539 aa  218  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.42 
 
 		 1543 aa  216  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  28.05 
 
 		 1593 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25.23 
 
 		 1539 aa  213  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.1 
 
 		 1495 aa  213  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.72 
 
 		 1528 aa  212  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  27.31 
 
 		 1528 aa  211  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1531 aa  211  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.6 
 
 		 1568 aa  210  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.76 
 
 		 1488 aa  210  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1586 aa  209  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.91 
 
 		 1508 aa  209  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.38 
 
 		 1385 aa  208  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1400 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1554 aa  205  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1611 aa  205  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1492 aa  204  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.84 
 
 		 1552 aa  203  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.8 
 
 		 1614 aa  203  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.33 
 
 		 1384 aa  201  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1386 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.21 
 
 		 1259 aa  200  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1466 aa  200  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  27.44 
 
 		 924 aa  199  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1558 aa  199  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1699 aa  198  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1411 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26 
 
 		 1626 aa  197  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  25.44 
 
 		 1681 aa  195  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  24.9 
 
 		 1573 aa  192  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1620 aa  191  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.6 
 
 		 1429 aa  191  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.54 
 
 		 1981 aa  191  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1553 aa  190  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1410 aa  190  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1419 aa  189  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.68 
 
 		 1639 aa  189  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.99 
 
 		 1489 aa  189  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1381 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1602 aa  187  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  187  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  187  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  187  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.09 
 
 		 903 aa  187  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.55 
 
 		 1509 aa  187  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1319 aa  186  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.8 
 
 		 1609 aa  185  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1527 aa  185  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  29.66 
 
 		 613 aa  184  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  23.88 
 
 		 1379 aa  183  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1541 aa  184  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1409 aa  183  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1317 aa  183  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.93 
 
 		 2294 aa  182  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.41 
 
 		 1494 aa  183  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1494 aa  183  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  28.02 
 
 		 1464 aa  182  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1541 aa  182  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1149 aa  182  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1541 aa  182  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.92 
 
 		 1362 aa  181  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>