More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2740 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  49.04 
 
 		 1554 aa  1233    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1602 aa  3288    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  37.49 
 
 		 1586 aa  860    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1547 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  33.36 
 
 		 1520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  33.18 
 
 		 1550 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.01 
 
 		 1362 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  32.76 
 
 		 1560 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.75 
 
 		 1551 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  33.83 
 
 		 1348 aa  536  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1527 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  31 
 
 		 1400 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  32.5 
 
 		 1446 aa  506  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1386 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  33.72 
 
 		 1421 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  31.4 
 
 		 1385 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  35.91 
 
 		 1609 aa  492  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.57 
 
 		 1568 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  30.68 
 
 		 1573 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1531 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  33.93 
 
 		 1411 aa  479  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1409 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  34.48 
 
 		 1429 aa  476  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  35.32 
 
 		 1981 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.71 
 
 		 1626 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  36.08 
 
 		 924 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1419 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  33.6 
 
 		 866 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  34.84 
 
 		 867 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  31.35 
 
 		 1620 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1229 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  31.78 
 
 		 1654 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  42.61 
 
 		 553 aa  394  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  30.62 
 
 		 1576 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.27 
 
 		 1586 aa  384  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1611 aa  383  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  29.08 
 
 		 1379 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.18 
 
 		 1595 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1410 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  33.19 
 
 		 1604 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  27.8 
 
 		 1530 aa  366  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  33.48 
 
 		 1583 aa  363  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  28.82 
 
 		 1359 aa  350  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1390 aa  339  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1402 aa  338  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  28.91 
 
 		 1140 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  59.12 
 
 		 422 aa  337  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1418 aa  336  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1317 aa  334  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.17 
 
 		 1485 aa  333  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1319 aa  328  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.45 
 
 		 1572 aa  327  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  27.85 
 
 		 1365 aa  326  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  27.75 
 
 		 1410 aa  325  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  28.68 
 
 		 1434 aa  323  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1397 aa  323  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.93 
 
 		 1614 aa  322  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1411 aa  321  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  27.49 
 
 		 1397 aa  319  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  27.65 
 
 		 1411 aa  319  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1377 aa  316  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  29.48 
 
 		 1508 aa  315  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  28.02 
 
 		 1308 aa  315  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  27.54 
 
 		 1377 aa  315  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  28.16 
 
 		 1388 aa  315  5.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  27.27 
 
 		 1411 aa  314  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  27.51 
 
 		 1397 aa  314  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  27.79 
 
 		 1397 aa  314  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  27.56 
 
 		 1411 aa  314  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  27.35 
 
 		 1411 aa  312  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1411 aa  312  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  27.45 
 
 		 1394 aa  311  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  28.06 
 
 		 1415 aa  310  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  28.04 
 
 		 1417 aa  309  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  27.52 
 
 		 1409 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  27.51 
 
 		 1399 aa  308  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.43 
 
 		 1509 aa  301  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.93 
 
 		 1259 aa  299  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  35.78 
 
 		 598 aa  296  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.46 
 
 		 1495 aa  293  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  28.84 
 
 		 1528 aa  292  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1509 aa  291  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1197 aa  291  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1525 aa  288  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1251 aa  287  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1352 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  36.42 
 
 		 583 aa  282  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  34.22 
 
 		 561 aa  281  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1552 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.43 
 
 		 1543 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.78 
 
 		 1579 aa  271  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  28.29 
 
 		 1428 aa  270  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1199 aa  267  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.29 
 
 		 1518 aa  266  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  33.44 
 
 		 555 aa  266  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.43 
 
 		 1384 aa  264  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  27.34 
 
 		 1528 aa  262  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  27.74 
 
 		 1679 aa  262  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.85 
 
 		 1494 aa  261  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1494 aa  261  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>